13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0630 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  391  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4216  hypothetical protein  41.5 
 
 
234 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559313  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  30.48 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0853  hypothetical protein  27.27 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1317  hypothetical protein  29.38 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  29.71 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  29.7 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.23 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  30 
 
 
199 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  41.25 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  26.9 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02745  putative transmembrane protein  25 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250875  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  30.43 
 
 
304 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>