25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2857 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2857  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  337  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  32.3 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  26.79 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  31.65 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  27.66 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  32.54 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  27.53 
 
 
197 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  32.28 
 
 
207 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  29.89 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  26.78 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  30.16 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  32.22 
 
 
209 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  35.26 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  25.97 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  29.59 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  37.31 
 
 
304 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  26.78 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  35.2 
 
 
202 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0688  hypothetical protein  28.48 
 
 
232 aa  47.8  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0630  hypothetical protein  34.27 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313929  normal  0.063756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  28.9 
 
 
208 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3178  hypothetical protein  28.05 
 
 
228 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.82146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2592  hypothetical protein  43.86 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.116352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  28.95 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0919  hypothetical protein  31.4 
 
 
194 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000270991  unclonable  1.59322e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>