24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3749 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  391  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8933  hypothetical protein  43.93 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00218357  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26780  hypothetical protein  52.2 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330222  normal  0.576099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3239  hypothetical protein  46.37 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1001  hypothetical protein  39.77 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1509  hypothetical protein  40.3 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6136  hypothetical protein  38.95 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1611  hypothetical protein  30.21 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2871  hypothetical protein  33.86 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222023  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4180  hypothetical protein  33.55 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.915841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  38.34 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0387561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0753  hypothetical protein  32.89 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.363396 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_716  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0732  hypothetical protein  28.72 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.606615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0838  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0957  hypothetical protein  27.37 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.665893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2401  hypothetical protein  31.54 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0812  PAP2 family protein  28.72 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0840  hypothetical protein  28.99 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0296573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1877  hypothetical protein  24.6 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0739  hypothetical protein  30.53 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0138  hypothetical protein  25.97 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4272  hypothetical protein  31.28 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.396078 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0630  hypothetical protein  30 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>