125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1998 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  83.8 
 
 
288 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.87 
 
 
286 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  60.42 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.97 
 
 
279 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  61.54 
 
 
286 aa  288  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2039  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.87 
 
 
282 aa  286  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.45 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.7 
 
 
278 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  60.97 
 
 
272 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.61 
 
 
278 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  59.7 
 
 
283 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12570  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  60.21 
 
 
295 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.867374  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2580  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.21 
 
 
270 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0154092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  58.09 
 
 
276 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1847  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  59.62 
 
 
282 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  56.18 
 
 
272 aa  244  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  47.96 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  hitchhiker  0.000202795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  54.81 
 
 
279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.26 
 
 
273 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.28 
 
 
277 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.56 
 
 
274 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.21 
 
 
281 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.97 
 
 
272 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3130  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.79 
 
 
292 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.85 
 
 
272 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.85 
 
 
272 aa  228  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0916  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.69 
 
 
303 aa  212  7e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  50.18 
 
 
286 aa  210  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0086  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  43.54 
 
 
283 aa  203  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.36 
 
 
320 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  45.99 
 
 
273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44 
 
 
359 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.5 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
264 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.1 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.46 
 
 
267 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  32.73 
 
 
311 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.95 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.35 
 
 
272 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.44 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.93 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.4 
 
 
258 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.04 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.94 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.15 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.55 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.03 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  36.44 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.39 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.47 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  39.13 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.04 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.5 
 
 
274 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.7 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.81 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.83 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.71 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.66 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1975  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.08 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.568621  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1075  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  41.06 
 
 
274 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.73 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.66 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.78 
 
 
287 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.45 
 
 
278 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.58 
 
 
306 aa  109  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.97 
 
 
271 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.89 
 
 
266 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.7 
 
 
285 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.48 
 
 
275 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.8 
 
 
275 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13603  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.66 
 
 
274 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.13 
 
 
283 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.82 
 
 
275 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.06 
 
 
307 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.47 
 
 
270 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1970  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.65 
 
 
272 aa  106  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476362  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.36 
 
 
274 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.71 
 
 
288 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3069  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.04 
 
 
276 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.201112  hitchhiker  0.00274028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.47 
 
 
264 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  38.24 
 
 
513 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.58 
 
 
276 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.04 
 
 
283 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.5 
 
 
273 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4108  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.43 
 
 
284 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.12 
 
 
284 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0006  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  36.44 
 
 
280 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>