127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3130 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3130  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  100 
 
 
292 aa  557  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1852  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  57.29 
 
 
278 aa  269  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4272  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.97 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15600  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  58.3 
 
 
283 aa  261  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1859  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.21 
 
 
278 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2039  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.82 
 
 
282 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579938  normal  0.0142296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3000  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.68 
 
 
286 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2433  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  55.48 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.74 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3742  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.26 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0768721 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.96 
 
 
288 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.691248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3155  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.37 
 
 
303 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  hitchhiker  0.000202795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1998  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.71 
 
 
290 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000649069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2580  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.82 
 
 
270 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2665  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  53.85 
 
 
277 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2368  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.61 
 
 
272 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0259026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2415  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.61 
 
 
272 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2409  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  54.96 
 
 
272 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11414  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  52.13 
 
 
274 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000186652  normal  0.109947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2341  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.36 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2407  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.14 
 
 
281 aa  225  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18010  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  53.05 
 
 
308 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0200906  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1320  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  46.92 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.382709  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  51.43 
 
 
286 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0351669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14780  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  46.62 
 
 
279 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12700  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  47.44 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0173626  normal  0.0283065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1847  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  50.18 
 
 
282 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12570  orotidine 5'-phosphate decarboxylase, subfamily 2  46.83 
 
 
295 aa  182  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.867374  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0916  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.02 
 
 
303 aa  163  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0086  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  36.21 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0951  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.74 
 
 
314 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09390  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.9 
 
 
311 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00166281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0614  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.49 
 
 
312 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2904  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.26 
 
 
320 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0953  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  40.67 
 
 
359 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0377509  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1444  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.57 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000534867  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4349  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  38.08 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0751763  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2713  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.83 
 
 
259 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0882  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.87 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000414792  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1801  orotidine 5-phosphate decarboxylase protein  38.76 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  46.15 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0347031  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2071  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.8 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3404  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.5 
 
 
271 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0610032  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30.07 
 
 
289 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.102908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0552  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.6 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1377  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  25.51 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2759  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.64 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.499942 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0240  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.68 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0594  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.32 
 
 
275 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3708  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.9 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0899629  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3050  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.88 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3018  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.6 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2608  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.6 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23667  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1199  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.56 
 
 
287 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0530325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0190  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.02 
 
 
272 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000350723  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0143  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.9 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0527  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.9 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0626  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.9 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260961  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0551  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.9 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771334  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0575744  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3478  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0401  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.46828  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1261  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3443  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3481  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3304  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.17 
 
 
275 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1816  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.07 
 
 
307 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00211539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0531  Orotidine-5'-phosphate decarboxylase  33.56 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2851  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.5 
 
 
302 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1184  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.85 
 
 
275 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.89 
 
 
271 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1223  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.84 
 
 
264 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  0.0822909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1384  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  29.2 
 
 
287 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.675621  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2773  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.47 
 
 
288 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.350308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0825  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.7 
 
 
274 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0219  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.92 
 
 
281 aa  102  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0925  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  30 
 
 
347 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4616  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.85 
 
 
285 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0197  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.88 
 
 
283 aa  99.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5082  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.67 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0073  orotidine 5'-monophosphate decarboxylase  32.78 
 
 
276 aa  98.6  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1586  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.9 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00897859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3776  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.67 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.09 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2203  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.74 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3450  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  33.45 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.799758  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3625  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.27 
 
 
278 aa  96.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0783  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  27.17 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4058  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186048  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1293  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.85 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3403  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  34.98 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57419  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0013  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.9 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4696  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.58 
 
 
274 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_12  orotidine 5-prime-phosphate decarboxylase  31.91 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0012  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  31.85 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.50788  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  33.45 
 
 
513 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0923  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  36.05 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1801  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.86 
 
 
273 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2322  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0824  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.23 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>