More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0880 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  99.41 
 
 
673 aa  1317    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0880  ABC transporter related  100 
 
 
673 aa  1326    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  95.09 
 
 
673 aa  1107    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0878  ABC transporter related  77.71 
 
 
694 aa  970    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.0940441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
688 aa  559  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
663 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
663 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  38.3 
 
 
685 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  38.8 
 
 
709 aa  442  1e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  38.08 
 
 
690 aa  442  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  38.07 
 
 
672 aa  439  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
632 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  37.05 
 
 
668 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  36.73 
 
 
646 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
656 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  41.27 
 
 
542 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  41.91 
 
 
540 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  41.18 
 
 
540 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  39.96 
 
 
545 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  41.91 
 
 
540 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  36.57 
 
 
638 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
645 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  41.73 
 
 
540 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  39.93 
 
 
549 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  38.27 
 
 
649 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  42.05 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1626  ABC transporter related  38.69 
 
 
619 aa  409  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  37.05 
 
 
651 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  41.73 
 
 
540 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3314  ABC transporter related  37.98 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 
545 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 
540 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  42.01 
 
 
545 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  40.54 
 
 
560 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  37.83 
 
 
652 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  41.73 
 
 
540 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  42.65 
 
 
540 aa  404  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 
650 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  37.13 
 
 
649 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2008  ABC transporter, ATPase subunit  37.78 
 
 
641 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198836  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  42.23 
 
 
540 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5212  ABC transporter related  41.4 
 
 
539 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  38.36 
 
 
543 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.04 
 
 
541 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  42.27 
 
 
540 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  39.03 
 
 
544 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  41.4 
 
 
548 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  42.52 
 
 
540 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  35.63 
 
 
667 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  41.36 
 
 
540 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  41.4 
 
 
548 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  36.8 
 
 
645 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  40.79 
 
 
565 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  38.6 
 
 
641 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  37.3 
 
 
535 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
540 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
643 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  38.36 
 
 
540 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.01 
 
 
637 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  36.31 
 
 
644 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
637 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  42.37 
 
 
540 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.69 
 
 
637 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  37.09 
 
 
664 aa  390  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
641 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  37.25 
 
 
650 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
635 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 
637 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1739  ABC transporter related  41.91 
 
 
540 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  33.88 
 
 
643 aa  388  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 
635 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.48 
 
 
639 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
635 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
635 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2216  ABC transporter related  40.26 
 
 
540 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  40.6 
 
 
653 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 
637 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
767 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
635 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  35.17 
 
 
636 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2125  ABC transporter related  35.98 
 
 
659 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457352  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  37.61 
 
 
652 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.75 
 
 
645 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 
659 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.57 
 
 
640 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  33.77 
 
 
637 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  37.59 
 
 
543 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
640 aa  382  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  33.88 
 
 
666 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 
640 aa  382  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 
635 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  36.52 
 
 
656 aa  378  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>