More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0195 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.96 
 
 
383 aa  651    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0195  histidine kinase  100 
 
 
384 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0175  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  91 
 
 
389 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.44 
 
 
763 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
763 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
763 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 
763 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 
592 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
592 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
592 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  44.49 
 
 
502 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
591 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
377 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2095  GAF sensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 
454 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
381 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
381 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2010  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
454 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
592 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2188  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
413 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
716 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.54 
 
 
518 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
383 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
383 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0395  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
509 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
403 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0506  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
383 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
1070 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3532  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3620  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
401 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  39.32 
 
 
501 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
406 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0755  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
588 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.452305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  34.4 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  34.05 
 
 
393 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
405 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.48 
 
 
393 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 
507 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
709 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
733 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
1070 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
543 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2664  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 
1069 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1116 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
977 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 
1201 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2759  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
591 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.612299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
625 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
596 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  31.19 
 
 
827 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
557 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
641 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
1069 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  38.25 
 
 
725 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2878  PAS sensor protein  27.48 
 
 
372 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  35.19 
 
 
586 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
970 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  36.67 
 
 
589 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.62 
 
 
1361 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  36.71 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
696 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
448 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1206  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
609 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165467  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
1171 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1084 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  30.83 
 
 
998 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
1362 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
917 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
907 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
476 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1222 aa  106  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
457 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
1010 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
979 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
399 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
1711 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
720 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 
755 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
621 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
1143 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  34.62 
 
 
423 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
572 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
721 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  29.61 
 
 
1364 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  39.83 
 
 
490 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
575 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
858 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1203 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1237 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  31.69 
 
 
910 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
785 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>