2619 genes were found for organism Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cphamn1_0001  CDS  NC_010831  1  1476  +  1476  chromosomal replication initiation protein  YP_001958471  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0002  CDS  NC_010831  1773  2897  +  1125  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001958472  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0003  CDS  NC_010831  2914  4005  +  1092  DNA replication and repair protein RecF  YP_001958473  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0004  CDS  NC_010831  4109  4402  +  294  hypothetical protein  YP_001958474  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0005  CDS  NC_010831  4548  5300  +  753  peptidase M50  YP_001958475  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0006  CDS  NC_010831  5622  6899  -  1278  beta-lactamase domain protein  YP_001958476  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0007  CDS  NC_010831  7022  9412  -  2391  DNA polymerase B region  YP_001958477  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0008  CDS  NC_010831  9486  11357  -  1872  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_001958478  normal  0.789732  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0009  CDS  NC_010831  12118  12492  +  375  cytochrome c class I  YP_001958479  normal  0.136601  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0010  CDS  NC_010831  12507  13799  +  1293  Flavocytochrome c sulphide dehydrogenase flavin-binding  YP_001958480  normal  0.011141  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0011  CDS  NC_010831  14086  15903  +  1818  preprotein translocase subunit SecD  YP_001958481  normal  0.019109  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0012  CDS  NC_010831  15927  16853  +  927  preprotein translocase subunit SecF  YP_001958482  decreased coverage  0.00000296376  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0013  CDS  NC_010831  16858  17691  +  834  hypothetical protein  YP_001958483  decreased coverage  0.00000147263  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0014  CDS  NC_010831  17725  19047  +  1323  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001958484  hitchhiker  0.000051018  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0015  CDS  NC_010831  19036  20970  -  1935  DNA gyrase, B subunit  YP_001958485  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0016  CDS  NC_010831  20997  21137  -  141  hypothetical protein  YP_001958486  hitchhiker  0.000284026  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0017  CDS  NC_010831  21181  21561  -  381  hypothetical protein  YP_001958487  hitchhiker  0.00052241  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0018  CDS  NC_010831  21575  22198  -  624  ribonuclease HII  YP_001958488  hitchhiker  0.000987865  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0019  CDS  NC_010831  22353  24065  +  1713  ribonuclease, Rne/Rng family  YP_001958489  decreased coverage  0.000156089  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0020  CDS  NC_010831  24316  25173  +  858  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_001958490  decreased coverage  0.0000761823  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0021  CDS  NC_010831  25214  26905  +  1692  carboxyl-terminal protease  YP_001958491  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0022  CDS  NC_010831  26895  27584  -  690  hypothetical protein  YP_001958492  normal  0.0154807  normal  0.704946  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0023  CDS  NC_010831  27585  28724  -  1140  geranylgeranyl reductase  YP_001958493  normal  0.086385  normal  0.74185  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0024  CDS  NC_010831  28826  30292  -  1467  glycyl-tRNA synthetase  YP_001958494  normal  1  normal  0.757041  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0025  CDS  NC_010831  30477  30608  -  132  hypothetical protein  YP_001958495  normal  1  normal  0.652066  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0026  CDS  NC_010831  30773  31360  +  588  hypothetical protein  YP_001958496  normal  1  normal  0.652066  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0027  CDS  NC_010831  31718  33085  +  1368  aminotransferase class V  YP_001958497  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0028  CDS  NC_010831  33469  33774  -  306  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  YP_001958498  normal  0.0842094  normal  0.917965  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0029  CDS  NC_010831  34128  35078  -  951  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  YP_001958499  normal  0.0259405  normal  0.953686  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0030  CDS  NC_010831  35162  35428  -  267  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  YP_001958500  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0031  CDS  NC_010831  35443  36831  -  1389  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_001958501  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0032  CDS  NC_010831  37167  37715  +  549  Redoxin domain protein  YP_001958502  decreased coverage  0.000000358102  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0033  CDS  NC_010831  37806  39665  +  1860  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_001958503  hitchhiker  0.00652728  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0034  CDS  NC_010831  40080  40280  +  201  hypothetical protein  YP_001958504  normal  0.0884764  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0035  CDS  NC_010831  40349  40564  -  216  protein of unknown function DUF1458  YP_001958505  normal  0.150781  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0036  CDS  NC_010831  40588  40725  -  138  hypothetical protein  YP_001958506  normal  0.134363  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0037  CDS  NC_010831  40839  41351  +  513  hypothetical protein  YP_001958507  normal  0.151182  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0038  CDS  NC_010831  41434  42216  +  783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_001958508  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0039  CDS  NC_010831  42408  42713  +  306  hypothetical protein  YP_001958509  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0040  CDS  NC_010831  42815  44347  +  1533  sodium:neurotransmitter symporter  YP_001958510  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0041  CDS  NC_010831  44542  45867  +  1326  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  YP_001958511  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0042  CDS  NC_010831  45860  46306  +  447  conserved hypothetical cytosolic protein  YP_001958512  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0043  CDS  NC_010831  46330  47856  -  1527  transposase IS4 family protein  YP_001958513  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0044  CDS  NC_010831  48067  48372  -  306  hypothetical protein  YP_001958514  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0045  CDS  NC_010831  48597  48860  +  264  hypothetical protein  YP_001958515  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0046  CDS  NC_010831  48910  49908  +  999  CHAP domain containing protein  YP_001958516  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0047  CDS  NC_010831  49910  50374  +  465  hypothetical protein  YP_001958517  normal  0.81292  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0048  CDS  NC_010831  50473  50577  +  105  hypothetical protein  YP_001958518  normal  0.388121  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0049    NC_010831  50574  52027  -  1454      normal  0.778115  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0050  CDS  NC_010831  52230  52928  +  699  cytochrome c class I  YP_001958519  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0051  CDS  NC_010831  53329  53571  -  243  hypothetical protein  YP_001958520  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0052  CDS  NC_010831  53645  55210  +  1566  Integrase catalytic region  YP_001958521  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0053  CDS  NC_010831  55228  55968  +  741  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_001958522  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0054  CDS  NC_010831  56069  56590  -  522  hypothetical protein  YP_001958523  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0055  CDS  NC_010831  56795  57031  -  237  hypothetical protein  YP_001958524  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0056  CDS  NC_010831  57126  57470  -  345  hypothetical protein  YP_001958525  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0057  CDS  NC_010831  57467  57691  -  225  protein of unknown function DUF433  YP_001958526  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0058  CDS  NC_010831  57715  58161  -  447  PilT protein domain protein  YP_001958527  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0059    NC_010831  58170  58367  -  198      normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0060  CDS  NC_010831  58520  59842  -  1323  amidohydrolase  YP_001958528  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0061  CDS  NC_010831  59817  59924  -  108  hypothetical protein  YP_001958529  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0062  CDS  NC_010831  59989  60303  +  315  hypothetical protein  YP_001958530  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0063    NC_010831  60300  61817  +  1518      normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0064  CDS  NC_010831  61934  63109  -  1176  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  YP_001958531  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0065    NC_010831  63214  63380  -  167      normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0066    NC_010831  63383  63544  +  162      normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0067    NC_010831  63629  64796  +  1168      normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0068  CDS  NC_010831  64936  65535  +  600  nucleotidyltransferase substrate binding protein, HI0074 family  YP_001958532  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0069  CDS  NC_010831  65532  65858  +  327  DNA polymerase beta domain protein region  YP_001958533  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0070  CDS  NC_010831  65972  66376  -  405  hypothetical protein  YP_001958534  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0071  CDS  NC_010831  66567  67145  +  579  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001958535  normal  0.867511  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0072  CDS  NC_010831  67205  69229  -  2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_001958536  normal  0.234386  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0073  CDS  NC_010831  69330  70388  +  1059  Radical SAM domain protein  YP_001958537  normal  0.127824  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0074  CDS  NC_010831  70536  72833  +  2298  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  YP_001958538  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0075  CDS  NC_010831  72836  73252  +  417  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  YP_001958539  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0076  CDS  NC_010831  73249  73614  +  366  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C  YP_001958540  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0077  CDS  NC_010831  73626  75128  +  1503  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001958541  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0078  CDS  NC_010831  75125  75598  +  474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  YP_001958542  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0079  CDS  NC_010831  75595  75870  +  276  multiple resistance and pH regulation protein F  YP_001958543  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0080  CDS  NC_010831  75863  76192  +  330  monovalent cation/proton antiporter, MnhG/PhaG subunit  YP_001958544  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0081  CDS  NC_010831  76319  76807  +  489  hypothetical protein  YP_001958545  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0082  CDS  NC_010831  76920  77174  +  255  hypothetical protein  YP_001958546  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0083  CDS  NC_010831  77291  77512  -  222  protein of unknown function nitrogen fixation  YP_001958547  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0084  CDS  NC_010831  77519  77857  -  339  hypothetical protein  YP_001958548  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0085  CDS  NC_010831  78018  78611  +  594  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  YP_001958549  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0086  CDS  NC_010831  78632  80533  +  1902  potassium efflux system protein  YP_001958550  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0087  CDS  NC_010831  80701  82158  -  1458  cation transporter  YP_001958551  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0088  CDS  NC_010831  82189  83577  -  1389  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001958552  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0089  CDS  NC_010831  83730  84500  -  771  hypothetical protein  YP_001958553  normal  0.575084  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0090  CDS  NC_010831  84605  85177  +  573  methionine-R-sulfoxide reductase  YP_001958554  normal  0.645705  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0091  CDS  NC_010831  85202  86410  -  1209  arsenite-activated ATPase ArsA  YP_001958555  normal  0.304953  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0092  CDS  NC_010831  86514  86696  -  183  hypothetical protein  YP_001958556  normal  0.202083  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0093  CDS  NC_010831  86755  87069  -  315  hypothetical protein  YP_001958557  normal  0.0126889  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0094  CDS  NC_010831  87304  87507  -  204  Ion transport 2 domain protein  YP_001958558  hitchhiker  0.00052241  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0095  CDS  NC_010831  87607  88209  -  603  hypothetical protein  YP_001958559  hitchhiker  0.000118998  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0096  CDS  NC_010831  88279  89352  -  1074  peptide chain release factor 1  YP_001958560  unclonable  0.000000153667  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0097  CDS  NC_010831  89382  90743  -  1362  membrane-associated zinc metalloprotease  YP_001958561  unclonable  0.000000512767  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0098  CDS  NC_010831  90804  91952  -  1149  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_001958562  hitchhiker  0.00415904  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0099  CDS  NC_010831  92311  92685  -  375  acylphosphatase  YP_001958563  normal  0.643538  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Cphamn1_0100  CDS  NC_010831  92669  94729  -  2061  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001958564  normal  1  normal  1  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>