14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0026 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0026  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0044  hypothetical protein  74.36 
 
 
195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.90338  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1257  hypothetical protein  52.45 
 
 
227 aa  199  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0251131  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1258  hypothetical protein  54.44 
 
 
209 aa  178  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.226492  normal  0.816885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2214  hypothetical protein  48 
 
 
211 aa  160  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1076  hypothetical protein  44.66 
 
 
212 aa  138  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1256  hypothetical protein  40.21 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00157199  normal  0.560162 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0475  hypothetical protein  39.18 
 
 
204 aa  115  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915929  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1100  hypothetical protein  40.7 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000114867  normal  0.436472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1102  hypothetical protein  40.7 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000127836  normal  0.983207 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1495  hypothetical protein  51.52 
 
 
105 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00154122  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1091  hypothetical protein  37.44 
 
 
201 aa  94.7  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.108727  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0518  hypothetical protein  28.86 
 
 
227 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.27927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1494  hypothetical protein  45.76 
 
 
68 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000124561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>