348 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNK00010  CDS  NC_006680  905  4960  +  4056  hypothetical protein  XP_567769  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00020  CDS  NC_006680  5192  7490  +  2299  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  XP_567770  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00030  CDS  NC_006680  8309  11682  +  3374  conserved hypothetical protein  XP_567772  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00040  CDS  NC_006680  11959  13831  -  1873  arsenite transporter, putative  XP_567773  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00050  CDS  NC_006680  14352  16049  -  1698  expressed protein  XP_567774  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00060  CDS  NC_006680  16743  19062  +  2320  beta-fructofuranosidase, putative  XP_567775  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00070  CDS  NC_006680  19050  22023  -  2974  phosphoketolase, putative  XP_567776  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00080  CDS  NC_006680  23454  25904  -  2451  lipid metabolism-related protein, putative  XP_567777  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00090  CDS  NC_006680  27477  30256  +  2780  conserved hypothetical protein  XP_567756  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00100  CDS  NC_006680  30894  34689  -  3796  ubiquitin-specific protease, putative  XP_567778  normal  0.0377728  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00110  CDS  NC_006680  34910  36328  +  1419  methyltransferase, putative  XP_567779  normal  0.011265  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00120  CDS  NC_006680  37186  38133  -  948  hypothetical protein  XP_567780  hitchhiker  0.00188869  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00130  CDS  NC_006680  38772  39957  -  1186  thioredoxin peroxidase, putative  XP_567781  normal  0.178013  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00140  CDS  NC_006680  40603  44073  +  3471  hypothetical protein  XP_567586  normal  0.518899  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00150  CDS  NC_006680  44205  45648  -  1444  hypothetical protein  XP_567587  normal  0.780404  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00160  CDS  NC_006680  48877  52896  +  4020  expressed protein  XP_567588  normal  0.0223126  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00170  CDS  NC_006680  53935  56245  +  2311  Tubulin gamma chain (Gamma tubulin), putative  XP_567730  normal  0.585998  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00180  CDS  NC_006680  56234  58107  -  1874  L-serine ammonia-lyase, putative  XP_567589  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00190  CDS  NC_006680  58526  59457  +  932  hypothetical protein  XP_567590  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00200  CDS  NC_006680  60292  61865  +  1574  conserved hypothetical protein  XP_567591  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00210  CDS  NC_006680  64798  67087  +  2290  RNA-binding protein sce3, putative  XP_567592  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00220  CDS  NC_006680  67149  68299  -  1151  cytoplasm protein, putative  XP_567593  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00230  CDS  NC_006680  68930  73307  +  4378  hypothetical protein  XP_567594  normal  0.879007  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00240  CDS  NC_006680  73600  76677  -  3078  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  XP_567731  normal  0.390509  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00250  CDS  NC_006680  77301  82826  -  5526  hypothetical protein  XP_567595  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00260  CDS  NC_006680  83341  85046  -  1706  expressed protein  XP_567596  normal  0.814513  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00270  CDS  NC_006680  86869  88680  -  1812  UDP-N-acetylglucosamine-dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase, putative  XP_567597  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00280  CDS  NC_006680  88897  90922  -  2026  phosphoglycerate mutase, putative  XP_567598  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00290  CDS  NC_006680  91067  92566  -  1500  conserved hypothetical protein  XP_567599  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00300  CDS  NC_006680  92747  94857  +  2111  cell wall chitin biosynthesis-related protein, putative  XP_567600  normal  0.574188  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00310  tRNA  NC_006680  95190  95282  -  93  tRNA-Tyr    normal  0.127181  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00320  CDS  NC_006680  99940  102347  +  2408  hypothetical protein  XP_567601  normal  0.061862  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00330  CDS  NC_006680  102711  105521  +  2811  cytoplasm protein, putative  XP_567602  normal  0.362081  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00340  CDS  NC_006680  105766  106459  +  694  hypothetical protein  XP_567603  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00350  CDS  NC_006680  107513  108886  -  1374  expressed protein  XP_567604  normal  0.475181  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00360  CDS  NC_006680  109043  110694  -  1652  autophagy-related protein, putative  XP_567605  normal  0.941753  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00370  CDS  NC_006680  111002  111940  +  939  hypothetical protein  XP_567606  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00380  CDS  NC_006680  113315  116661  +  3347  membrane transporter, putative  XP_567607  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00390  CDS  NC_006680  117289  119152  +  1864  sodium-hydrogen antiporter  XP_567608  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00400  CDS  NC_006680  120112  123295  -  3184  cytoplasm protein, putative  XP_567609  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00410  CDS  NC_006680  123468  124000  +  533  hypothetical protein  XP_567610  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00420  CDS  NC_006680  124176  128574  +  4399  conserved hypothetical protein  XP_567611  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00430  CDS  NC_006680  129063  131504  -  2442  cytoplasm protein, putative  XP_567612  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00440  CDS  NC_006680  131800  133564  +  1765  expressed protein  XP_567613  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00450  CDS  NC_006680  137003  137474  +  472  hypothetical protein  XP_567614  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00460  CDS  NC_006680  137693  138705  -  1013  35S primary transcript processing-related protein, putative  XP_567615  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00470  CDS  NC_006680  138941  139615  +  675  mitochondrion protein, putative  XP_567616  normal  0.10842  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00480    NC_006680  140137  143328  +  3192      decreased coverage  0.00608774  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00490    NC_006680  146937  152747  +  5811      normal  0.0199944  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00500    NC_006680  152774  154423  -  1650      normal  0.0152578  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00510    NC_006680  156019  161577  +  5559      normal  0.0748048  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00520    NC_006680  161860  166401  -  4542      normal  0.0285744  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00530    NC_006680  168732  169346  +  615      hitchhiker  0.000284706  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00540  CDS  NC_006680  178627  180642  -  2016  hypothetical protein  XP_567617  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00550  CDS  NC_006680  182325  184860  -  2536  conserved hypothetical protein  XP_567619  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00560  CDS  NC_006680  185139  189339  +  4201  delta DNA polymerase, putative  XP_567620  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00570  CDS  NC_006680  189343  191257  -  1915  expressed protein  XP_567621  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00580  CDS  NC_006680  191404  193804  +  2401  homoaconitate hydratase, putative  XP_567622  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00590  CDS  NC_006680  193872  197499  -  3628  fork head homolog XFD-2, putative  XP_567623  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00600  CDS  NC_006680  199140  204360  +  5221  endocytosis-related protein, putative  XP_567624  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00610  CDS  NC_006680  204989  206274  +  1286  hypothetical protein  XP_567625  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00620  tRNA  NC_006680  206609  206701  -  93  tRNA-Glu    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00630  CDS  NC_006680  207497  209832  -  2336  hypothetical protein  XP_567626  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00640  CDS  NC_006680  210243  214378  +  4136  conserved hypothetical protein  XP_567627  normal  0.901927  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00650  CDS  NC_006680  214880  216565  +  1686  hypothetical protein  XP_567628  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00660  CDS  NC_006680  217448  218915  -  1468  RAB small monomeric GTPase, putative  XP_567629  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00670  CDS  NC_006680  219245  221293  +  2049  hypothetical protein  XP_567630  normal  0.957922  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00680  CDS  NC_006680  221601  223526  +  1926  oxidoreductase, putative  XP_567631  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00690  CDS  NC_006680  223571  226087  -  2517  regulation of meiosis-related protein, putative  XP_567632  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00700  tRNA  NC_006680  226387  226495  -  109  tRNA-Gly    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00710  CDS  NC_006680  228538  233458  +  4921  hypothetical protein  XP_567633  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00720  CDS  NC_006680  233810  235810  -  2001  conserved hypothetical protein  XP_567634  normal  0.629397  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00730  CDS  NC_006680  236236  238449  +  2214  conserved hypothetical protein  XP_567635  normal  0.236908  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00740  CDS  NC_006680  239383  241414  +  2032  hypothetical protein  XP_567636  normal  0.635907  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00750  CDS  NC_006680  241827  243122  +  1296  protein phosphatase type 2A regulator, putative  XP_567637  normal  0.503825  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00760  CDS  NC_006680  243205  245514  -  2310  conserved hypothetical protein  XP_567638  normal  0.36017  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00770  CDS  NC_006680  247006  248679  -  1674  hypothetical protein  XP_567640  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00780  CDS  NC_006680  248928  251260  +  2333  hypothetical protein  XP_567641  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00790  CDS  NC_006680  252276  253481  -  1206  conserved hypothetical protein  XP_567642  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00800  CDS  NC_006680  253960  256973  +  3014  expressed protein  XP_567732  normal  0.860316  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00810  CDS  NC_006680  257701  261290  +  3590  hypothetical protein  XP_567643  normal  0.510095  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00820  CDS  NC_006680  261573  264154  -  2582  expressed protein  XP_567644  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00830  CDS  NC_006680  265979  268246  +  2268  conserved hypothetical protein  XP_567646  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00840  CDS  NC_006680  268930  270786  +  1857  conserved hypothetical protein  XP_567647  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00850  CDS  NC_006680  271174  272175  -  1002  conserved hypothetical protein  XP_567648  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00860  CDS  NC_006680  272731  274848  +  2118  conserved hypothetical protein  XP_567649  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00870  CDS  NC_006680  275286  275912  -  627  conserved hypothetical protein  XP_567650  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00880  CDS  NC_006680  276461  278512  +  2052  conserved hypothetical protein  XP_567651  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00890  CDS  NC_006680  278719  281362  -  2644  early growth response protein 1 (egr-1), putative  XP_567652  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00900  CDS  NC_006680  281595  285527  -  3933  hypothetical protein  XP_567653  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00910  CDS  NC_006680  286039  288234  -  2196  tbc1 domain family protein, putative  XP_567654  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00920  CDS  NC_006680  288372  290831  +  2460  hypothetical protein  XP_567655  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00930  CDS  NC_006680  290985  295814  -  4830  DNA ligase (ATP), putative  XP_567656  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00940  CDS  NC_006680  296390  297469  -  1080  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  XP_567782  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00950  CDS  NC_006680  297631  299743  +  2113  Pol II transcription elongation factor, putative  XP_567783  normal  0.110026  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00960  CDS  NC_006680  299770  302700  -  2931  conserved hypothetical protein  XP_567784  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00970  CDS  NC_006680  302936  303894  +  959  conserved hypothetical protein  XP_567785  normal  0.531752  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00980  CDS  NC_006680  304073  306055  +  1983  expressed protein  XP_567786  normal  0.442642  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK00990  CDS  NC_006680  306228  307430  -  1203  hypothetical protein  XP_567787  normal  0.505388  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNK01000  CDS  NC_006680  307624  310230  +  2607  conserved hypothetical protein  XP_567788  normal  0.0847196  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>