33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00110 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00110  methyltransferase, putative  100 
 
 
314 aa  619  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.011265  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80065  U3 snoRNP protein  74.26 
 
 
325 aa  367  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00745  hypothetical protein similar to fibrillarin, nucleolar protein (Eurofung)  71.55 
 
 
317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32524  predicted protein  72.65 
 
 
243 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.072896  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48920  predicted protein  70.34 
 
 
317 aa  349  4e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1107  fibrillarin  48.1 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0401  fibrillarin  48.1 
 
 
235 aa  208  1e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.939186  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1366  fibrillarin  46.84 
 
 
235 aa  206  3e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0331367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1723  fibrillarin  49.53 
 
 
233 aa  206  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1727  fibrillarin  47.68 
 
 
235 aa  205  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.319108  hitchhiker  0.000219848 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1310  fibrillarin  46.47 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.374179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1916  fibrillarin  42.62 
 
 
232 aa  199  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0377  fibrillarin  46.35 
 
 
233 aa  192  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.939654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1009  fibrillarin  43.93 
 
 
230 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0295  fibrillarin  43.93 
 
 
230 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1619  fibrillarin  43.72 
 
 
232 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0804  fibrillarin  46.85 
 
 
226 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1469  fibrillarin  45.33 
 
 
230 aa  185  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1561  fibrillarin  45.95 
 
 
230 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0628275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0761  fibrillarin  42.13 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1392  fibrillarin  41.04 
 
 
224 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0517  fibrillarin  48.59 
 
 
199 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0661  fibrillarin  40.85 
 
 
212 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0465318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1636  fibrillarin  42.7 
 
 
200 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0542  fibrillarin  41.55 
 
 
200 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0406  fibrillarin  40.98 
 
 
208 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2087  fibrillarin  41.15 
 
 
211 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2744  fibrillarin  39.89 
 
 
207 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.819778 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0694  fibrillarin  40.19 
 
 
217 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2264  fibrillarin  41.76 
 
 
205 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0802859  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0150  fibrillarin  34.83 
 
 
211 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2238  fibrillarin  40 
 
 
213 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.665661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1042  fibrillarin  39.05 
 
 
212 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>