12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK00970 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00970  conserved hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.531752  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65879  predicted protein  47.64 
 
 
200 aa  215  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0223662 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14089  predicted protein  44.21 
 
 
206 aa  186  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08488  Putative synaptobrevin YKT6 (Eurofung)  43.64 
 
 
197 aa  180  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_51073  predicted protein  44.55 
 
 
200 aa  162  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00798092  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54066  predicted protein  30.07 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478736  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02090  vesicle-associated membrane protein 712, putative  31.94 
 
 
306 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32248  predicted protein  27.33 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.672355  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00571  synaptobrevin/VAMP-like protein (Eurofung)  29.27 
 
 
263 aa  48.5  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0440913 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03510  v-SNARE, putative  33.93 
 
 
120 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64252  predicted protein  22.95 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.823304  normal  0.145167 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17683  predicted protein  35.19 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>