117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_B0034 on replicon NC_009705
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  100 
 
 		 682 aa  1415    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1580 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1448 aa  173  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  34.17 
 
 		 1448 aa  172  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1495 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.86 
 
 		 986 aa  164  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1077 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  36.25 
 
 		 323 aa  160  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  33.44 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  33.74 
 
 		 320 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  33.24 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  34.73 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  31.31 
 
 		 296 aa  147  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  33.66 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  35.42 
 
 		 314 aa  144  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  33.03 
 
 		 335 aa  143  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  34.21 
 
 		 284 aa  143  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  31.38 
 
 		 384 aa  140  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  35.21 
 
 		 321 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  32.34 
 
 		 1716 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  34.39 
 
 		 333 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  34.45 
 
 		 319 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  34.4 
 
 		 285 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  32.89 
 
 		 308 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  33.33 
 
 		 328 aa  137  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  31.99 
 
 		 1457 aa  134  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  32.03 
 
 		 312 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  34.83 
 
 		 301 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  33.11 
 
 		 326 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  32.3 
 
 		 1449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  34.11 
 
 		 362 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  33.66 
 
 		 315 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  32.2 
 
 		 308 aa  130  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  32.3 
 
 		 308 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  31.46 
 
 		 312 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  33.33 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  31.79 
 
 		 280 aa  127  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  33.33 
 
 		 326 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  32.57 
 
 		 304 aa  127  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  34.04 
 
 		 332 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  31.17 
 
 		 311 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  34.04 
 
 		 332 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  32.86 
 
 		 297 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  31.13 
 
 		 322 aa  126  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  33.12 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  33.68 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  34.04 
 
 		 434 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  32.19 
 
 		 306 aa  124  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  33.33 
 
 		 313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  29.49 
 
 		 299 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  31.06 
 
 		 308 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  29.26 
 
 		 316 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  31.56 
 
 		 306 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  30.56 
 
 		 338 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  31.41 
 
 		 301 aa  120  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  28.81 
 
 		 318 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  29.56 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  31.94 
 
 		 295 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  33 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  29.9 
 
 		 313 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  28.79 
 
 		 320 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1159  domain of unknown function DUF1738  27.86 
 
 		 389 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  32.75 
 
 		 299 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  30.49 
 
 		 308 aa  118  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  29.68 
 
 		 308 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  30.67 
 
 		 285 aa  118  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  30.72 
 
 		 312 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  32.69 
 
 		 311 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  29.93 
 
 		 327 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  29.5 
 
 		 316 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  31.44 
 
 		 288 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  30.6 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  30.23 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  30.23 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  30.24 
 
 		 287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  29.14 
 
 		 317 aa  113  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  34.24 
 
 		 242 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  30.69 
 
 		 318 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  32.18 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  31.58 
 
 		 306 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  27.95 
 
 		 322 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  31.33 
 
 		 321 aa  110  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  30.8 
 
 		 325 aa  110  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  29.64 
 
 		 310 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  28.67 
 
 		 319 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  29.43 
 
 		 297 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  28.76 
 
 		 319 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  29.14 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  29.74 
 
 		 311 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  30.42 
 
 		 320 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  26.76 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  29.29 
 
 		 299 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  30.38 
 
 		 660 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  30.45 
 
 		 276 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  29.76 
 
 		 300 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  27.24 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  31.07 
 
 		 300 aa  99  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  28.21 
 
 		 304 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  28.67 
 
 		 300 aa  98.6  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  27.39 
 
 		 310 aa  96.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>