48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0210 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  95.18 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  95.61 
 
 		 228 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  72.33 
 
 		 209 aa  300  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  73.74 
 
 		 209 aa  298  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  65.5 
 
 		 205 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  67.34 
 
 		 217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 378 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  53.89 
 
 		 338 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  53.89 
 
 		 338 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 341 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  53.89 
 
 		 341 aa  208  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 333 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  53.89 
 
 		 773 aa  207  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 340 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  47.98 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  25.77 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 497 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 244 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 205 aa  42  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 184 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 235 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 232 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 188 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  20.45 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>