25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3421 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013531  Xcel_3421  type II secretion system protein  100 
 
 		 303 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2224  type II secretion system protein  54.67 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0840  type II secretion system protein  48.17 
 
 		 301 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0384483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0673  Type II secretion system F domain protein  38.56 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4455  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4140  type II secretion system protein  32.01 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8205  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.914565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4033  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268876  hitchhiker  0.00614024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4968  type II secretion system protein  35.69 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1308  hypothetical protein  31.17 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2592  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 301 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1734  type II secretion system protein  34.44 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0156723  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1543  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2760  hypothetical protein  30.79 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119849  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4646  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 305 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.750596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4724  integral membrane protein  27.91 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.783417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6892  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00267588  normal  0.473446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3132  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8597  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0722577  normal  0.464587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1225  Type II secretion system F domain protein  26.26 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  27.63 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3330  type II secretion system protein  27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0799285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1362  type II secretion system protein  32.85 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 292 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  22.77 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>