91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2915 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2915  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1690  hypothetical protein  44 
 
 
232 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.86 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  29.2 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  29.2 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  26.15 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  32.06 
 
 
343 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  31.7 
 
 
371 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  29.03 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.33 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  32.29 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  22.07 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  29.87 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  25.12 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  30.57 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  27.27 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  28.87 
 
 
372 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  27.83 
 
 
376 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  25.12 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  26.91 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.87 
 
 
372 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  28.9 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.87 
 
 
372 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  34.38 
 
 
228 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  24.74 
 
 
230 aa  52  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  33.61 
 
 
239 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.6 
 
 
360 aa  52  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  27.7 
 
 
374 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  40.91 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.57 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  28.37 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.63 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.9 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  25.69 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  33.61 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.75 
 
 
396 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  28.65 
 
 
376 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.69 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.54 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  42.37 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  37.35 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  32.84 
 
 
263 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.69 
 
 
358 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  34.31 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  34.21 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  31.46 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  44.44 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  23.92 
 
 
227 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  34.21 
 
 
233 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  24.54 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  35.42 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  37.97 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  39.64 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  26.53 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  28.32 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  29.3 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.11 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.24 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  39.06 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  39.06 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  32.79 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  35.79 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  36.14 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  27.86 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  31.4 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  43.33 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.67 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  22.58 
 
 
361 aa  45.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.67 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  36.05 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  36.71 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  30.97 
 
 
365 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  29.82 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  41.67 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.67 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  25.32 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.57 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.86 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  29.13 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  40.58 
 
 
387 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  33.04 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  39.44 
 
 
368 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  23.46 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  26.51 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  41.67 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  27.53 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  33.94 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  23.39 
 
 
229 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  35.57 
 
 
239 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>