More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1111 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  66.18 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  63.16 
 
 		 212 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  61.35 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  62.2 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  60.29 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  62.93 
 
 		 211 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  60.29 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  67.48 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  71.05 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  58.65 
 
 		 212 aa  214  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  61.06 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  58.37 
 
 		 212 aa  207  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 219 aa  206  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  60.1 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 215 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  55.67 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  63.55 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  58.54 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  60.87 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  56.16 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  63.55 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  59.8 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 217 aa  194  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  58.85 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  56.19 
 
 		 212 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  62.14 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  50.25 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  59.22 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  61.17 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  57.67 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  55.45 
 
 		 194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  54.85 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  59.57 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  48.08 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  48.08 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  46.19 
 
 		 223 aa  160  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  54.85 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  54.37 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  47.14 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.49 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2380  cytidylate kinase  45.05 
 
 		 243 aa  148  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.042532  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  50 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  44.91 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.81 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  42.99 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0616  cytidylate kinase  36.36 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  39.62 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  42.16 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  44.61 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  45.29 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  44.25 
 
 		 237 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.73 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  47.96 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  41.1 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  47.06 
 
 		 228 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  39.44 
 
 		 226 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  39.37 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1232  cytidylate kinase  40.47 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  44.17 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  35.53 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  35.87 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  40.67 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.55 
 
 		 705 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 251 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  40.48 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  45.1 
 
 		 232 aa  138  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.93 
 
 		 653 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  40.91 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  40 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 252 aa  137  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.12 
 
 		 699 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.66 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  43.2 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.05 
 
 		 668 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  45.83 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  38.64 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  41.36 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  39.01 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  41.55 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  45.75 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  41 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>