More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1324 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  66.34 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  66.02 
 
 		 208 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  53.2 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  52.94 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  55.61 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  57.14 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  52.4 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  51.72 
 
 		 212 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  52.22 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  51.94 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  54.59 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  49.76 
 
 		 219 aa  175  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  50.98 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  49.52 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  51.2 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  53.92 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  53.92 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  51.96 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  53.66 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  48.8 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  51.92 
 
 		 211 aa  160  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  49.51 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  53.37 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  50.48 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  52.88 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  52.45 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  51.22 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  43.33 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 212 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  44.61 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  45.45 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  54.17 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  37.1 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0564  cytidylate kinase  43.26 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 226 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.14 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.14 
 
 		 226 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  43.72 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  40.18 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  41.82 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02861  cytidylate kinase  39.55 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  40.99 
 
 		 234 aa  138  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  44.12 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  39.22 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3123  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.78 
 
 		 705 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.921195  normal  0.0155282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.16 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  42.58 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  50.26 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  40 
 
 		 232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  38.81 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  43.27 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  38.97 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  35.75 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.98 
 
 		 667 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  42.33 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  43.13 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  34.43 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  37.93 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  38.18 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  33.8 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  36.16 
 
 		 230 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.34 
 
 		 674 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  36.04 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.14 
 
 		 675 aa  131  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  36.65 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.14 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  36.49 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  44.39 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  40.95 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.88 
 
 		 643 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  34.11 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.04 
 
 		 511 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>