More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1304 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  64.22 
 
 
219 aa  264  5.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  64.22 
 
 
219 aa  263  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  60.48 
 
 
215 aa  256  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  63.05 
 
 
212 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  60.77 
 
 
217 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  59.52 
 
 
215 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  59.33 
 
 
218 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  62.14 
 
 
214 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  51.67 
 
 
212 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  51.2 
 
 
212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  50.72 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  50.24 
 
 
212 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  51.67 
 
 
212 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  49.75 
 
 
216 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  52.71 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  49.76 
 
 
211 aa  194  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  50.79 
 
 
208 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  49.76 
 
 
209 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  46.23 
 
 
212 aa  185  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  50 
 
 
222 aa  184  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  45.81 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  52.11 
 
 
222 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  52.11 
 
 
222 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  49.49 
 
 
194 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  51.94 
 
 
217 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  49.26 
 
 
217 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  47.29 
 
 
203 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  50 
 
 
212 aa  171  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  45.41 
 
 
212 aa  168  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  43.35 
 
 
208 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  42.72 
 
 
226 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  42.72 
 
 
226 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  45.15 
 
 
213 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  46.8 
 
 
206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  43.84 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  44.85 
 
 
211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  46.31 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  44.74 
 
 
208 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  50.79 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  44.66 
 
 
219 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2243  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.78 
 
 
674 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  40.2 
 
 
232 aa  155  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  39.52 
 
 
226 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  42.23 
 
 
221 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0641  cytidylate kinase  41.23 
 
 
237 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1536  cytidylate kinase  41.23 
 
 
237 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000588366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  37.84 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  42.58 
 
 
228 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  42.58 
 
 
228 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  42.58 
 
 
228 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  41.87 
 
 
229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  42.38 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0908  cytidylate kinase  41.46 
 
 
230 aa  151  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  38.01 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  40.54 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  39.39 
 
 
225 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  42.58 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1197  cytidylate kinase  38.5 
 
 
221 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  42.11 
 
 
209 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  45.26 
 
 
204 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  38.57 
 
 
227 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2334  cytidylate kinase  38.65 
 
 
226 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000116453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2403  cytidylate kinase  37.16 
 
 
230 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  38.99 
 
 
231 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  41.35 
 
 
667 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  41.83 
 
 
231 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  36.94 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  40.87 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.35 
 
 
643 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  38.33 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  41.15 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  38.46 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  41.15 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  41.38 
 
 
255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0254  cytidylate kinase  39.02 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.13077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  37.93 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  36.7 
 
 
230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  36.7 
 
 
230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  37.38 
 
 
225 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  36.7 
 
 
230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  36.7 
 
 
230 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  36.62 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  40.67 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  40.67 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  40.67 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  40.67 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  37.61 
 
 
221 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  36.24 
 
 
230 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  39.64 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  36.24 
 
 
230 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  36.24 
 
 
230 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  36.67 
 
 
227 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  36.07 
 
 
228 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0902  cytidylate kinase  39.42 
 
 
226 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1024  cytidylate kinase  39.42 
 
 
226 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000194676  unclonable  0.0000000000298139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  38.21 
 
 
237 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  42.92 
 
 
228 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0544  cytidylate kinase  36.24 
 
 
220 aa  144  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.773366  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  37.2 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>