More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2406 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  100 
 
 		 222 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  99.55 
 
 		 222 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  92.34 
 
 		 222 aa  345  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  80.68 
 
 		 212 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  73.56 
 
 		 217 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  66.01 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  76.84 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  59.9 
 
 		 212 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  57.28 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  57.28 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  58.45 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  63.55 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  60.19 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  57.97 
 
 		 212 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  57.35 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  57.21 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  59.31 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  57.49 
 
 		 216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  56.52 
 
 		 212 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  58.45 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  54.68 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  56.22 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  59.8 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  56.52 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  52.43 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  50.97 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  55.29 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  51.23 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  56.16 
 
 		 208 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  57.62 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  55.17 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  53.88 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  52.43 
 
 		 203 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  53.43 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  53.97 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  52.76 
 
 		 211 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  41.89 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  52.71 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  47.85 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  49.25 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  47.09 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.78 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  46.12 
 
 		 667 aa  158  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  40.65 
 
 		 218 aa  158  8e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  46.79 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  46.33 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  45.93 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  44.29 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  42.6 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.64 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.5 
 
 		 670 aa  151  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  44.76 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2070  cytidylate kinase  44.24 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000348998  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  53.62 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1291  cytidylate kinase  50 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  45.16 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  54.21 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  39.73 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  45.97 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  42.86 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 226 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1790  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.19 
 
 		 668 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  44.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  46.92 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  40.62 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  44.5 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  41.67 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0688  cytidylate kinase  44.16 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.29 
 
 		 699 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  42.73 
 
 		 233 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003019  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000338917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  43.75 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00890  cytidylate kinase  41.2 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.007598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3036  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  42.59 
 
 		 653 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00127659  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.28 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  41.52 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1541  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1598  cytidylate kinase  42.4 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  40.72 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  38.65 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  37.61 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  37.67 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>