More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1443 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 283 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  67.84 
 
 		 284 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  68.55 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  64.41 
 
 		 281 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  66.55 
 
 		 284 aa  311  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  68.68 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  62.59 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  63.48 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  61.35 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  52.65 
 
 		 279 aa  218  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2845  phosphatidate cytidylyltransferase  50.9 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  41.05 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2450  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  40.89 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1687  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426329  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  39.12 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  39.15 
 
 		 268 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2578  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2432  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0787111  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2488  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3260  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0696258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1550  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2051  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1323  phosphatidate cytidylyltransferase  49.61 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.077571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.78 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 271 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  40.93 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  40.93 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  38.65 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  35.86 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.89 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  37.85 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  40.78 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  33.67 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 271 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  51.41 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  37.89 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  33.78 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  30.82 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0662  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.86 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  34.05 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  32.23 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  34.05 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  33.45 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  33.45 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  33.45 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  35.58 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  32.31 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  33.11 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  30.72 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  31.96 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  33 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  32.08 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  35.75 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  36.55 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  33.75 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  29.49 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  32.11 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  30.07 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  44.23 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  30.17 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  31.74 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  30.42 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>