More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1396 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
364 aa  752    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3330  oxidoreductase domain protein  33.71 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0129274  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  33.9 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3076  dehydrogenase-like protein  36.5 
 
 
342 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0613  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 
360 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 
341 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2081  oxidoreductase, NAD-binding  26.54 
 
 
337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.57998  normal  0.0114237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2281  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.991839  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2173  oxidoreductase, NAD-binding  25.98 
 
 
337 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.312886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
359 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30.6 
 
 
353 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3818  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
442 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
369 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 
377 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 
435 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
311 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  30.21 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02858  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11930)  28.12 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57106  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
359 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  30.96 
 
 
425 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.1 
 
 
312 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  28.2 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  26.94 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
345 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
358 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  29.2 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06430  dehydrogenase, putative  27.74 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  32.12 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.3 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  29.27 
 
 
429 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  26.67 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  23.66 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.5 
 
 
359 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4715  dehydrogenase  25 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.187326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 
341 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 
344 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  25.14 
 
 
388 aa  89  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  25.11 
 
 
372 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
360 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
387 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 
360 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  23.92 
 
 
387 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2775  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0108511  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  28.88 
 
 
335 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.13 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  27.41 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.05 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  25.47 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  25.46 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  22.84 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  31.82 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
517 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  27.35 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  27.31 
 
 
517 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.01 
 
 
349 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.91 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  26.64 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  29.25 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.22 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  27.86 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1905  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  23.16 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.33 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
385 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  28.71 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  28.51 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  26.15 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.33 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>