More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5886 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5886  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 481 aa  971    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4046  Aldehyde Dehydrogenase  46.67 
 
 		 467 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  40.51 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  40.3 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  38.89 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 		 470 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 486 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  39.24 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 535 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.7 
 
 		 476 aa  286  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 		 479 aa  285  9e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  38.9 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  36.97 
 
 		 463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3789  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 		 515 aa  282  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 		 475 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 		 484 aa  280  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  38.69 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6604  betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 489 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.362654 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  37.24 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  37.65 
 
 		 510 aa  276  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.95 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.69 
 
 		 498 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 		 480 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1471  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 490 aa  270  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00283478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.48 
 
 		 480 aa  269  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  35.33 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 		 467 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.75 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  35.87 
 
 		 492 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  37.9 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 		 472 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  40.05 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 468 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  39.3 
 
 		 481 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1602  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase I (NADP+) (SSDH)  37.77 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1944  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 474 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0167894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 		 488 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.4 
 
 		 485 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  34.45 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  36.67 
 
 		 493 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.84 
 
 		 488 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 		 512 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  37.1 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  36.81 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6720  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 		 490 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.34 
 
 		 489 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.34 
 
 		 489 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  34.79 
 
 		 507 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 479 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.14 
 
 		 483 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3841  betaine aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 489 aa  259  7e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 482 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.98 
 
 		 480 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 482 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2673  aldehyde dehydrogenase family protein  36.96 
 
 		 493 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  36.51 
 
 		 485 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.36 
 
 		 483 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.81 
 
 		 478 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.29 
 
 		 510 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.76 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.06 
 
 		 505 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 517 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2568  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.951924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4593  aldehyde dehydrogenase  37.73 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.59 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.66 
 
 		 482 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.59 
 
 		 482 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 477 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.41 
 
 		 493 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.59 
 
 		 482 aa  257  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.45 
 
 		 482 aa  256  4e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.91 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.59 
 
 		 482 aa  257  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.91 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  35.82 
 
 		 503 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.45 
 
 		 482 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.19 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.17 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.23 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.1 
 
 		 479 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>