More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5557 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  898    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  83.17 
 
 		 438 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  73.85 
 
 		 432 aa  627  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  73.61 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  73.61 
 
 		 432 aa  624  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  74.56 
 
 		 433 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  73.32 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  73.32 
 
 		 429 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  69.69 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  53.37 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  52.84 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 		 441 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  51.34 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  53.45 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  51.59 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  50 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  53.06 
 
 		 441 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  49.76 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  52.31 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  50.61 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  52.57 
 
 		 419 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 437 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  48.84 
 
 		 439 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  47.21 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  45.35 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  47.94 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  46.62 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  49.65 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  47.38 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 447 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 417 aa  338  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  45.09 
 
 		 443 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 428 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  41.2 
 
 		 430 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 421 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  37.09 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.41 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.38 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.99 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.2 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.46 
 
 		 402 aa  136  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  29.2 
 
 		 402 aa  136  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.61 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.61 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.61 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.91 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.65 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.65 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.65 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.65 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.65 
 
 		 400 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.4 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.4 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 414 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.4 
 
 		 400 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.59 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 402 aa  127  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>