147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5152 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  100 
 
 		 382 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  67.45 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  68.04 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  62.5 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  62.77 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  62.77 
 
 		 380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  59.42 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  58.93 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  57.91 
 
 		 456 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  46.67 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  52.08 
 
 		 397 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  39.74 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  38.8 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.24 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  38.76 
 
 		 374 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  40.55 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  38.65 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  39.02 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  40.45 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  41.27 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  39.94 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  40.65 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  39.88 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  39.66 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  39.64 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.92 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  39.66 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  39.66 
 
 		 374 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  39.32 
 
 		 410 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  38.75 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  38.46 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  35.4 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  37.36 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  36.64 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  36.01 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.18 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  34.06 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.68 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  35.54 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  37.68 
 
 		 418 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.05 
 
 		 543 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  33.82 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  33.82 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  35.32 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  35.04 
 
 		 542 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.97 
 
 		 500 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.01 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  33.5 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  34.11 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.57 
 
 		 502 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  37.62 
 
 		 341 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  35.71 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  33.58 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.69 
 
 		 506 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  33.24 
 
 		 368 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  35.13 
 
 		 362 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  34.24 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  34.49 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  42.51 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  34.14 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  42.11 
 
 		 341 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  25.61 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  33.33 
 
 		 352 aa  163  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  31.95 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.87 
 
 		 381 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  32.7 
 
 		 497 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  32.6 
 
 		 405 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  32.56 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  29.34 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  31.73 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1375  MltA domain-containing protein  33.7 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.164926  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  31.63 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  33.23 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  30.24 
 
 		 475 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  34.82 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  34.91 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  35.29 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  32.01 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  34.64 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  32.14 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  29.81 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  31.79 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  32.8 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  31.71 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  31.77 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  35.56 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  33.45 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  36.92 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  32.4 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  31.02 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  32.4 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  32.75 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0392  membrane-bound lytic transglycosylase A  34.78 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0639  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  56.59 
 
 		 134 aa  123  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.229529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>