145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0392 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0392  membrane-bound lytic transglycosylase A  100 
 
 
392 aa  783    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  52.23 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  52.48 
 
 
386 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0967  MltA  47.38 
 
 
411 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.820227  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  51.07 
 
 
389 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  51.07 
 
 
389 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3159  MltA domain-containing protein  49.73 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0344  MltA  46.31 
 
 
397 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.075779  normal  0.0460048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  38.02 
 
 
405 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  33.57 
 
 
514 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  40.22 
 
 
416 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  36.64 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.2 
 
 
399 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  34.77 
 
 
395 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  33.57 
 
 
386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  33.8 
 
 
395 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  33.22 
 
 
385 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  34.74 
 
 
383 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  35.88 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  35.47 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  34.86 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  33.45 
 
 
392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  34.4 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  33.45 
 
 
392 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.33 
 
 
400 aa  145  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  34.16 
 
 
341 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  33.09 
 
 
383 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  33.1 
 
 
382 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  34.52 
 
 
376 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  33.07 
 
 
356 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  33.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  33.76 
 
 
475 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.8 
 
 
342 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  32.68 
 
 
397 aa  143  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  36.5 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  37.85 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  39.13 
 
 
410 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  35.11 
 
 
386 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  39.13 
 
 
410 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  37.55 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  39.13 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  35.31 
 
 
410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  35.39 
 
 
410 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.01 
 
 
351 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  38.74 
 
 
410 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
372 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
425 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  36.12 
 
 
341 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
425 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
425 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.16 
 
 
425 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.34 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  32.26 
 
 
375 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  32.57 
 
 
395 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.33 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  38.34 
 
 
409 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  34.46 
 
 
374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  34.44 
 
 
384 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  31.96 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  36.26 
 
 
368 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  34.86 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  34.52 
 
 
418 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  32.83 
 
 
369 aa  132  9e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  33.54 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  30.68 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  32.45 
 
 
362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  32.6 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  31.94 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  30.54 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  32.72 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  33.09 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  30.97 
 
 
371 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  31.73 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  35.8 
 
 
380 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.9 
 
 
397 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  29.72 
 
 
543 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  35.8 
 
 
384 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  31.62 
 
 
542 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  31.99 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  34.42 
 
 
382 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  32.46 
 
 
365 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  32.08 
 
 
387 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  35.41 
 
 
380 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.18 
 
 
502 aa  123  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  30.68 
 
 
412 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  34.33 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.25 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  32.09 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  32.09 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.09 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  32.09 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  30.86 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  30.86 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  30.5 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  33.21 
 
 
396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  32.09 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  32.09 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  32.09 
 
 
365 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  32.95 
 
 
390 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>