145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0899 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 		 365 aa  757    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  100 
 
 		 365 aa  757    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  100 
 
 		 355 aa  735    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  99.45 
 
 		 365 aa  752    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  90.14 
 
 		 365 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  100 
 
 		 365 aa  757    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  100 
 
 		 365 aa  757    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  100 
 
 		 365 aa  757    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  100 
 
 		 355 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3810  murein transglycosylase A  72.83 
 
 		 380 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00265681  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  72.7 
 
 		 371 aa  555  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  70.19 
 
 		 378 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0995  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.341613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  68.94 
 
 		 387 aa  546  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1047  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3187  murein transglycosylase A  71.51 
 
 		 387 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2992  murein transglycosylase A  46.98 
 
 		 370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1899  murein transglycosylase A  48.81 
 
 		 368 aa  332  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  48.43 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0687  murein transglycosylase A  46.2 
 
 		 366 aa  325  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03293  murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 411 aa  322  9.000000000000001e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002690  membrane-bound lytic murein transglycosylase A precursor  47.62 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  47.66 
 
 		 395 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  31.08 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  35.02 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.83 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  36.53 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  34.39 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  34.72 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  34.43 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  35.19 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  31.33 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  35.56 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.11 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  35.11 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  41.43 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  33.33 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.29 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  33.33 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  34.73 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  30.11 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  35.11 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  34.48 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  29.57 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  35.38 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  35.85 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.2 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  34.48 
 
 		 409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  32.99 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  34.48 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  34.48 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  32.99 
 
 		 383 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  34.94 
 
 		 374 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.05 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  34.1 
 
 		 374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  34.72 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  33.67 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.97 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  31.11 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  28.65 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  31.27 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  32.96 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  32.96 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  31.43 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  35.79 
 
 		 405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  31.11 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  35.45 
 
 		 514 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  35.03 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  37.14 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  36.29 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  35.34 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  29.97 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  34.98 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.45 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  39.75 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  39.75 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  30.18 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  39.02 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.29 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  33.44 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  33.08 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0392  membrane-bound lytic transglycosylase A  32.09 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  32.83 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  33.87 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  33.21 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  31.18 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  30.74 
 
 		 421 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  32.72 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  31.73 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  31.41 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.69 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  33.33 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  32.66 
 
 		 375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>