145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2992 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2992  murein transglycosylase A  100 
 
 		 370 aa  756    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1899  murein transglycosylase A  58.79 
 
 		 368 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0687  murein transglycosylase A  54.5 
 
 		 366 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03293  murein transglycosylase A  54.55 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002690  membrane-bound lytic murein transglycosylase A precursor  56.2 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3187  murein transglycosylase A  47.28 
 
 		 387 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  49.13 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  46.22 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0995  murein transglycosylase A  47.49 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.341613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  47.49 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1047  murein transglycosylase A  47.49 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  45.88 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.98 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  46.98 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  46.98 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  46.98 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  46.98 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  47.44 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  47.44 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  46.7 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  46.72 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3810  murein transglycosylase A  46.94 
 
 		 380 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00265681  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  44.41 
 
 		 363 aa  296  4e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  43.56 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  37.87 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  36.53 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  36.53 
 
 		 395 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  35.32 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.79 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  36.57 
 
 		 410 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.14 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  37.72 
 
 		 514 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  36.7 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  35.32 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 372 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.11 
 
 		 410 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.31 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  37.11 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  37.11 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  36.57 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  37.11 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.96 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  36.8 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  36.48 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  36.72 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  34.34 
 
 		 410 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  35.04 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  34.73 
 
 		 475 aa  143  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.96 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  36.73 
 
 		 352 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  35.61 
 
 		 381 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  36.21 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.23 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  36.23 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  35.69 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  36.47 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  36.76 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  31.73 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  31.73 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.03 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  35.25 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  36.23 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  34.67 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.74 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  35.25 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  33.46 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  35.54 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  35.85 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  32.21 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.03 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  35.66 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  33.2 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  34.72 
 
 		 362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  32.58 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.66 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  33.61 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  34.34 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  36.07 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  31.15 
 
 		 372 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  32.57 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  32.71 
 
 		 542 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.26 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  32.48 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  33.21 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.08 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  32.31 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  30.68 
 
 		 500 aa  125  9e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  32.54 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  31.72 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  31.52 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  33.21 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  26.4 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  35.16 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  33.21 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  32 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  31.32 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>