145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03293 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002690  membrane-bound lytic murein transglycosylase A precursor  88.38 
 
 		 367 aa  664    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03293  murein transglycosylase A  100 
 
 		 411 aa  851    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1899  murein transglycosylase A  81.46 
 
 		 368 aa  608  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0687  murein transglycosylase A  63.39 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2992  murein transglycosylase A  54.55 
 
 		 370 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  45.74 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  45.71 
 
 		 371 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 365 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  45.45 
 
 		 365 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 365 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 365 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 365 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  45.64 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  45.64 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  45.45 
 
 		 365 aa  319  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  42.86 
 
 		 387 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  43.91 
 
 		 378 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0995  murein transglycosylase A  43.53 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.341613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  43.53 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1047  murein transglycosylase A  43.53 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3187  murein transglycosylase A  42.82 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3810  murein transglycosylase A  42.45 
 
 		 380 aa  299  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00265681  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  42.32 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  44.11 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  38.01 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  36.84 
 
 		 401 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  34.8 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  34.8 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 399 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.76 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  35.77 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  36.64 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  33.94 
 
 		 397 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  37.45 
 
 		 396 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  35.53 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  31.66 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  37.22 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  34.2 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  33.82 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  34.06 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  37.22 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  35.77 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  31.35 
 
 		 500 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  33.96 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.36 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.96 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  33.7 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  33.58 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  33.58 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  33.58 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  33.46 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  32.86 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  32.85 
 
 		 421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.21 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  32.78 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  33.58 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  34.33 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  33.83 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  34.08 
 
 		 514 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  30.16 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.9 
 
 		 502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  33.83 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  33 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  33.33 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  31.94 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.71 
 
 		 374 aa  126  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  29.9 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  32.2 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  32.32 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  32.2 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  31.79 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  32.84 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  32.99 
 
 		 392 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  33.82 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  29.26 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  33.68 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  27.86 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  32.65 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.29 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.45 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  32.3 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  32.4 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  31.97 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  32.99 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  31.96 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  32.46 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  30.39 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  31.29 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  31.97 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  32.22 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  30.96 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  34.48 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  29.85 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  32.66 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  31.51 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>