146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0606 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  100 
 
 		 358 aa  733    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  45.74 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  42.7 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  41.39 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  41.37 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  39.27 
 
 		 381 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  40.07 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  39.16 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  39.15 
 
 		 440 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  38.58 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  40.38 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  40.75 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  40.75 
 
 		 341 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  37.59 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  40.48 
 
 		 342 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.59 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  38.36 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  38.49 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  32.91 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  35.34 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  37.92 
 
 		 475 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  31.78 
 
 		 514 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  38.11 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  33.07 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  31.37 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  37.97 
 
 		 421 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  37.4 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  36.58 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  36.64 
 
 		 392 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  36.26 
 
 		 392 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  36.64 
 
 		 383 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  36.53 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  35.96 
 
 		 386 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  36.64 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  35.96 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  36.33 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  32.2 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  36.47 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  32.2 
 
 		 396 aa  136  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  35.21 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  32.19 
 
 		 386 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 425 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  36.96 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  36.58 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.55 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  34.54 
 
 		 374 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  35.8 
 
 		 410 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.8 
 
 		 410 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  28.69 
 
 		 416 aa  132  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  30.85 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  35.41 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  34.77 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  35.8 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  34.59 
 
 		 542 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  35.41 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  34.38 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  31.14 
 
 		 396 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  37.04 
 
 		 363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  34.93 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  35.37 
 
 		 380 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  32.11 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  35.37 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  34.15 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  29.71 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  33.99 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  38.78 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.73 
 
 		 500 aa  122  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  32.33 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  33.2 
 
 		 543 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3187  murein transglycosylase A  33.47 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  33.96 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  34.15 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  29.66 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  29.66 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  33.6 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  33.47 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.37 
 
 		 502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  32.09 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  33.87 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  33.87 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  32.27 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  32.27 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  35.27 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  34.5 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1899  murein transglycosylase A  33.47 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  36.32 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.69 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  32.66 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0995  murein transglycosylase A  32.66 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.341613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  32.66 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1047  murein transglycosylase A  32.66 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>