145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1047 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0995  murein transglycosylase A  100 
 
 		 390 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.341613  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3225  murein transglycosylase A  100 
 
 		 390 aa  807    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502086  normal  0.589954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1047  murein transglycosylase A  100 
 
 		 390 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3383  murein transglycosylase A  76.28 
 
 		 387 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3810  murein transglycosylase A  79.29 
 
 		 380 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00265681  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0921  murein transglycosylase A  76.41 
 
 		 378 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.865037  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3003  murein transglycosylase A  78.02 
 
 		 371 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3187  murein transglycosylase A  77.84 
 
 		 387 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02664  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0875  MltA domain protein  69.95 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.668939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2959  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.23679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3119  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0330645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0899  murein transglycosylase A  69.95 
 
 		 365 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3057  murein transglycosylase A  69.67 
 
 		 365 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287575  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3259  murein transglycosylase A  68.58 
 
 		 365 aa  541  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4078  murein transglycosylase A  70.14 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2954  murein transglycosylase A  70.14 
 
 		 355 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.218547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2992  murein transglycosylase A  47.49 
 
 		 370 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0687  murein transglycosylase A  45.89 
 
 		 366 aa  332  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.287847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1899  murein transglycosylase A  46.55 
 
 		 368 aa  323  4e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  46.46 
 
 		 363 aa  318  9e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002690  membrane-bound lytic murein transglycosylase A precursor  45.66 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03293  murein transglycosylase A  43.53 
 
 		 411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  50 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  36.23 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  35.9 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  38.52 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  35.94 
 
 		 397 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  37.11 
 
 		 393 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  38.35 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  32.71 
 
 		 398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  32.71 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  35.32 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0886  MltA domain protein  32.32 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  hitchhiker  0.00895003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1143  MltA domain protein  37.17 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000848892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.94 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  34.94 
 
 		 374 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  34.94 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  35.32 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  35.02 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  34.94 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  34.94 
 
 		 410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  37.78 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  35.61 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  34.47 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  35.71 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.83 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  36.4 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  36.03 
 
 		 372 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.45 
 
 		 372 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  35.97 
 
 		 352 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  35.87 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  35.66 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  38.24 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  35.56 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  37.55 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  34.09 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  33.46 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  31.84 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  34.4 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  32.4 
 
 		 386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.34 
 
 		 543 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.06 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.29 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1368  MltA domain protein  33.08 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  38.65 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1398  MltA domain protein  33.08 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  34.64 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  35 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  35.07 
 
 		 362 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  35.58 
 
 		 475 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  37.79 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  34.78 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  36.12 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  33.21 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  36.63 
 
 		 372 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  34.29 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  38.89 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  32.88 
 
 		 500 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  34.7 
 
 		 369 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  34.04 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  38.89 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  37.6 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  34.06 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  34.16 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  33.21 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  33.1 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  33.21 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  35.29 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  30.29 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  32.5 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0392  membrane-bound lytic transglycosylase A  32.95 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  31.32 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  29.28 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>