More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5040 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5040  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3619  enoyl-CoA hydratase  81.69 
 
 		 284 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.397236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0495  enoyl-CoA hydratase  80.28 
 
 		 284 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.227335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0591  enoyl-CoA hydratase  79.93 
 
 		 284 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4071  enoyl-CoA hydratase  71.05 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0279  enoyl-CoA hydratase  70.68 
 
 		 283 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7165  enoyl-CoA hydratase  70.3 
 
 		 283 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2200  enoyl-CoA hydratase  72.83 
 
 		 283 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0179241  normal  0.0692381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4470  enoyl-CoA hydratase  76.12 
 
 		 285 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114118  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2114  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  73.68 
 
 		 269 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 283 aa  387  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.18 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2182  enoyl-CoA hydratase  75 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  69.32 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0825  enoyl-CoA hydratase  69.7 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3834  enoyl-CoA hydratase  71.8 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.532762 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3947  enoyl-CoA hydratase  71.8 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0950827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2277  enoyl-CoA hydratase  68.56 
 
 		 272 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02010  enoyl-CoA hydratase  69.17 
 
 		 283 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3177  enoyl-CoA hydratase  71.43 
 
 		 284 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0869314  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5090  enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 		 270 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1326  enoyl-CoA hydratase  66.92 
 
 		 268 aa  343  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.63963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  61.65 
 
 		 278 aa  331  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1204  enoyl-CoA hydratase  65 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2240  enoyl-CoA hydratase  66.54 
 
 		 267 aa  322  4e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.08 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  44.65 
 
 		 275 aa  242  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.52 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  32.06 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  32.82 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 		 262 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  31.68 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  33.86 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  31.3 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  32.84 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.24 
 
 		 255 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  33.59 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  30.42 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.69 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.44 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  32.56 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  32.03 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 277 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.38 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6846  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.86 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.55 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2444  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.41 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  33.21 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.53 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.65 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.85 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  33.58 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.07 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.93 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  32.67 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2540  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.893236  normal  0.33655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  35.06 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  30.08 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1836  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.395714  normal  0.321075 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 		 268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.99 
 
 		 267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.48 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.26 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  30.04 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  30.6 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  33.07 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.23 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>