56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1525 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1525  TadE family protein  100 
 
 		 152 aa  304  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  44.79 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  48.78 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  34.78 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0796  TadE-like  35.93 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  35.54 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  38.82 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  35.54 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  36.53 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  32.73 
 
 		 722 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  35.54 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  34.34 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  34.34 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  33.73 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  32.53 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  34.36 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002647  hypothetical protein  33.7 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  47.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  35.54 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  32.43 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  34.94 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  39.02 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  35.14 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  37.93 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  37.93 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  37.93 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  36.73 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  38.78 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  31.71 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  30.93 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  38.71 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  36.67 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  35.14 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  33.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  33.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  40.38 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  26.36 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  31.65 
 
 		 189 aa  43.9  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  39.58 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  30.69 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  26.32 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4400  TadE family protein  30.77 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  35.19 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  35.42 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  32.65 
 
 		 148 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  40 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3919  TadE family protein  39.29 
 
 		 122 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  40.98 
 
 		 204 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  40 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4621  TadE family protein  29.27 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.37805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  29.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  38.33 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  32.65 
 
 		 152 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>