More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0821 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1299    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  42.58 
 
 		 605 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0167  hypothetical protein  45 
 
 		 379 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000240644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1497  NirV precursor  36.6 
 
 		 387 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  35.58 
 
 		 291 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  37.68 
 
 		 292 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 		 570 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  31.09 
 
 		 413 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  31.83 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  29.51 
 
 		 628 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  27.51 
 
 		 549 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  29.84 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  27.51 
 
 		 600 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  31.08 
 
 		 616 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  30.16 
 
 		 654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.7 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 		 657 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  32.09 
 
 		 535 aa  117  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.48 
 
 		 277 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.42 
 
 		 348 aa  115  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 		 348 aa  115  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  32.05 
 
 		 433 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  26.92 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  33.98 
 
 		 390 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  34.47 
 
 		 523 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.85 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  35.48 
 
 		 826 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.2 
 
 		 319 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  36.6 
 
 		 240 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.45 
 
 		 292 aa  108  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.32 
 
 		 284 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  28.42 
 
 		 292 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  28.88 
 
 		 282 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  31.23 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.64 
 
 		 517 aa  103  8e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  31.05 
 
 		 491 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  29.6 
 
 		 283 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  31.39 
 
 		 325 aa  101  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  28.83 
 
 		 288 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  32.14 
 
 		 259 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  30.26 
 
 		 331 aa  97.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.16 
 
 		 286 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 829 aa  97.1  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  25.77 
 
 		 586 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  27.49 
 
 		 246 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  28.99 
 
 		 324 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  33.04 
 
 		 327 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  29.18 
 
 		 742 aa  92  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.05 
 
 		 293 aa  91.7  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  28.52 
 
 		 892 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1251  serine/threonine protein kinase  31.88 
 
 		 555 aa  90.9  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  31.84 
 
 		 877 aa  90.5  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  27.4 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 611 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  26.82 
 
 		 300 aa  90.1  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 		 398 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  29.13 
 
 		 330 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.29 
 
 		 319 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.32 
 
 		 554 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  29.19 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  33.03 
 
 		 301 aa  87.4  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  87.4  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 882 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  26.13 
 
 		 291 aa  87  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  30.81 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  32.72 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  26.1 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  28.08 
 
 		 263 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.31 
 
 		 925 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  32.87 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  33.47 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  28.93 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.13 
 
 		 820 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  33.05 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  33.05 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  26.78 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  31.51 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  28.72 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  30.66 
 
 		 291 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  35.33 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  34.55 
 
 		 329 aa  83.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  30.91 
 
 		 334 aa  83.2  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.35 
 
 		 1104 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  27.87 
 
 		 287 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  32.42 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  24.18 
 
 		 929 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  30.74 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  31.18 
 
 		 1132 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  33.18 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  32.72 
 
 		 1049 aa  80.9  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>