More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0725 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 144 aa  298  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0285  nucleoside diphosphate kinase  77.46 
 
 		 142 aa  243  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000362394  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  78.01 
 
 		 141 aa  239  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  75.18 
 
 		 141 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 143 aa  210  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3130  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 143 aa  209  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0990343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1254  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 142 aa  207  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2741  Nucleoside-diphosphate kinase  66.67 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3018  nucleoside diphosphate kinase  68.09 
 
 		 142 aa  207  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1182  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0422  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.920358  normal  0.0102374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2390  nucleoside diphosphate kinase  67.38 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00297694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2417  nucleoside-diphosphate kinase  66.67 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1289  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3613  nucleoside diphosphate kinase  64.54 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.367991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1747  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000066664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1827  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 143 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00692161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1301  nucleoside diphosphate kinase  65.25 
 
 		 143 aa  201  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378961  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2141  nucleoside diphosphate kinase  64.54 
 
 		 143 aa  199  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000896706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2272  nucleoside diphosphate kinase  64.54 
 
 		 143 aa  199  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000444266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2802  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1114  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2377  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000377324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2389  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00124206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1970  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570351  hitchhiker  0.000372949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2493  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000115766  hitchhiker  0.00287307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2274  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  196  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2310  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  196  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00703116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2886  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4256  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1430  nucleoside diphosphate kinase  65.96 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2862  nucleoside diphosphate kinase  63.83 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.760882  hitchhiker  0.0000000204456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2678  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2765  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2721  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2896  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2784  nucleoside diphosphate kinase  61.7 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  62.5 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1123  nucleoside diphosphate kinase  62.41 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1498  nucleoside diphosphate kinase  60.28 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2850  nucleoside diphosphate kinase  63.12 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0731  Nucleoside-diphosphate kinase  60.28 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1783  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000760949 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1248  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  58.33 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3504  nucleoside diphosphate kinase  60.28 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0647  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.415341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0849  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0678  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.910925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0879  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1792  nucleoside diphosphate kinase  60.28 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1307  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  59.57 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4605  nucleoside diphosphate kinase  59.57 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14820  nucleoside diphosphate kinase  58.87 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1906  nucleoside diphosphate kinase  60.28 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0892  nucleoside diphosphate kinase  58.16 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000198835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1430  nucleoside diphosphate kinase  58.16 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1244  nucleoside diphosphate kinase  58.16 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2052  Nucleoside-diphosphate kinase  56.03 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.238298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4329  nucleoside diphosphate kinase  58.16 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000143413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0899  nucleoside-diphosphate kinase  57.45 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  62.41 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3160  nucleoside diphosphate kinase  63.08 
 
 		 139 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00622384 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  57.97 
 
 		 139 aa  176  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1717  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1781  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1234  nucleoside-diphosphate kinase  56.12 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0263228  normal  0.0520892 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  57.66 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06114  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01052  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.299785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1656  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.110606  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0925  nucleoside diphosphate kinase  60.29 
 
 		 139 aa  174  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.621681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3333  nucleoside-diphosphate kinase  56.83 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148108 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2992  nucleoside diphosphate kinase  54.23 
 
 		 159 aa  173  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000780378  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1505  nucleoside diphosphate kinase  55.32 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1478  nucleoside diphosphate kinase  56.03 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2169  nucleoside diphosphate kinase  58.27 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0387  nucleoside diphosphate kinase  56.74 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  53.9 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1759  nucleoside diphosphate kinase  56.83 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2380  nucleoside-diphosphate kinase  55.32 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1979  nucleoside diphosphate kinase  55.4 
 
 		 140 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0775  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0514  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.321088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0894  nucleoside diphosphate kinase  56.12 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.139474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_004310  BR0694  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.900866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2311  nucleoside-diphosphate kinase  56.39 
 
 		 141 aa  167  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0861887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>