148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06652 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  70.83 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.36 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.36 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  41.67 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  38.54 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  46.48 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  39.53 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.37 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  40.85 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.89 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.71 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  38.96 
 
 
112 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  40.3 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  40.3 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.4 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
94 aa  52  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.44 
 
 
98 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  36.84 
 
 
104 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
114 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  31.17 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
101 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.43 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  38.03 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.62 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.62 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.72 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
99 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.39 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  31.31 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  35.38 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>