64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05889 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  90.76 
 
 
240 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  73.71 
 
 
240 aa  323  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  61.28 
 
 
242 aa  275  4e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  51.91 
 
 
242 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  42.74 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  42.67 
 
 
245 aa  168  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  40.26 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  40.26 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  39.66 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  40.26 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  40.26 
 
 
247 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  39.83 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  41.13 
 
 
247 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 
247 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  40.69 
 
 
247 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  40.26 
 
 
247 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  40.81 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  40.28 
 
 
244 aa  152  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  38.74 
 
 
242 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  41.63 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  42.98 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  35.05 
 
 
241 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  37.62 
 
 
241 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  32.05 
 
 
238 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  30.22 
 
 
268 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  32.52 
 
 
251 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  34.78 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  37.27 
 
 
239 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  30.77 
 
 
236 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  30.09 
 
 
241 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  29.71 
 
 
235 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2191  hypothetical protein  30.34 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.496448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  32.3 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2292  hypothetical protein  28.64 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.353248  normal  0.347992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.98 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  32.71 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
257 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  29.59 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  29.55 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  29.55 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  28.81 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  30.59 
 
 
241 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  27.23 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  28.81 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
244 aa  48.9  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.48 
 
 
272 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.72 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  29.34 
 
 
241 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  29.32 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  28.29 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  26.63 
 
 
278 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  26.74 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  26.88 
 
 
255 aa  41.6  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>