34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04921 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  64.43 
 
 		 884 aa  1194    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1817    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  23.04 
 
 		 954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  23.87 
 
 		 954 aa  180  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  24.4 
 
 		 847 aa  146  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  23.2 
 
 		 934 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0695  hypothetical protein  40.65 
 
 		 926 aa  82  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.91131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1232  hypothetical protein  25.08 
 
 		 899 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  27.2 
 
 		 893 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  25.59 
 
 		 915 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2614  membrane protein-like  27.85 
 
 		 939 aa  73.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.284738  normal  0.14506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  34.94 
 
 		 894 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1111  hypothetical protein  31.4 
 
 		 901 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.661792  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  24.62 
 
 		 915 aa  70.5  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  28.19 
 
 		 900 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  29.22 
 
 		 920 aa  64.3  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  28.19 
 
 		 900 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  23.4 
 
 		 1312 aa  62  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4712  hypothetical protein  43 
 
 		 910 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00644592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  24.73 
 
 		 833 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  26.87 
 
 		 949 aa  55.1  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  22.66 
 
 		 600 aa  54.7  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  23.49 
 
 		 921 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  26.06 
 
 		 957 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  21.78 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.69 
 
 		 587 aa  51.6  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  26.18 
 
 		 953 aa  50.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  21.86 
 
 		 778 aa  49.7  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  21.76 
 
 		 823 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1045 aa  47.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1048 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  24.82 
 
 		 938 aa  46.2  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3151  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1064 aa  44.3  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1063 aa  44.3  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>