More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001036 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001036  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1045  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.74 
 
 
330 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1171  quinone oxidoreductase  35.11 
 
 
323 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0911  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  35.45 
 
 
330 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4256  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  35.95 
 
 
330 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0916  alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
330 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1080  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.44 
 
 
331 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5820500000000002e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0939  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.05 
 
 
331 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1004  alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
331 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1099  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.91 
 
 
324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0928  NADPH:quinone reductase (quinone oxidoreductase)  34.14 
 
 
330 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1609  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.138634  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1916  putative alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
326 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192129  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4679  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.72 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599367  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4733  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.37 
 
 
322 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3905  alcohol dehydrogenase  27.63 
 
 
327 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2212  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
326 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0202578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2636  alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
326 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5937  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.91 
 
 
323 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3191  alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 
325 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0350764 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0497  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
322 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382641  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0019  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
325 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.68 
 
 
333 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000452539  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0729  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30 
 
 
344 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175245  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0017  alcohol dehydrogenase  25.84 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.430943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2753  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.98 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.549338  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0012  nuclear receptor binding factor related protein  26.87 
 
 
325 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2297  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.76 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.184467  normal  0.147784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2880  alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.57 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  27.36 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.2 
 
 
347 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1199  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.45 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4572  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.36 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5520  putative dehydrogenase/oxidoreductase  24.84 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566328  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1909  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0510  alcohol dehydrogenase  27.05 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3593  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.28 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03606  NADPH quinone reductase or zn-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.153323  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1173  alcohol dehydrogenase  26.02 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.32 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.25 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.8 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.31 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2841  alcohol dehydrogenase  23.98 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0506355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.22 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.69 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  25.45 
 
 
322 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0316  alcohol dehydrogenase  25.25 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2461  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.78 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.61 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0122  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.25 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.51 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3483  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  25.33 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.265979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0886  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.27 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0277  alcohol dehydrogenase  25.81 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  24.28 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.89 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5113  alcohol dehydrogenase  28.68 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1409  alcohol dehydrogenase  31.75 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395097  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  24.17 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2472  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  25.74 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1742  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  23.87 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.69 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  24.32 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  27.45 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1322  alcohol dehydrogenase  24.55 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0680057  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  24.45 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.09 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5739  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.31 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.382073  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.12 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  24.17 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45262  predicted protein  26.56 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235786  normal  0.755284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.93 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.07 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2967  alcohol dehydrogenase  27.04 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.57 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  23.23 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.4 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.1 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  23.28 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  24.77 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  28.76 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0245  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  23.88 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  25.31 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  24.26 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  24.61 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.1 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  24.4 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.2 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  24.01 
 
 
322 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.74 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1925  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.84 
 
 
317 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000755536  normal  0.120319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  26.61 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>