57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2675 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  100 
 
 		 238 aa  498  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  70.46 
 
 		 238 aa  345  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1414  CRISPR-associated protein Cas5 family  54.24 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.136655  normal  0.0675969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2163  CRISPR-associated protein Cas5 family  54.31 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.193051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.68 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  35.11 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  33.48 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.67 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.5 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.13 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.89 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.74 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  34.84 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.64 
 
 		 234 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  34.04 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  31.79 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.5 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  37.16 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.74 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.64 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.87 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  29.95 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  34.91 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  37.8 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  31.43 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  30.8 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.4 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.76 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.12 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  30.68 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  35.67 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.76 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0861  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.38 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2232  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.12 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0955  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.97 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2987  CRISPR-associated Cas5 family protein  29.59 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0931  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.97 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4010  CRISPR-associated protein Cas5  27.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3059  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.78 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2896  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.35 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.586448  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2885  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.16 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.582573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0597  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.9 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000345339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1388  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.26 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0230  CRISPR-associated Cas5e family protein  27.47 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0401  CRISPR-associated protein Cas5 family  32.35 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0308989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3544  CRISPR-associated Cas5 family protein  27.38 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.29 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1590  CRISPR-associated Cas5 family protein  25.44 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.57 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3150  CRISPR-associated Cas5 family protein  28.31 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.635269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0951  CRISPR-associated Cas5 family protein  26.88 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0906811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3094  CRISPR-associated protein Cas5  27.71 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.18699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.98 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3587  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.11 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0932  CRISPR-associated Cas5e family protein  26.59 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.767604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  39.06 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2476  CRISPR-associated protein Cas5 family  28.74 
 
 		 271 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>