34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2828 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3757  CRISPR-associated Cas5e family protein  45.56 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.364301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17210  CRISPR-associated protein, CT1976  43.43 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1234  CRISPR-associated protein Cas5 family  45.81 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00117259  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3015  Cas5 family CRISPR-associated protein  46.11 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000337648  normal  0.0242997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2339  CRISPR-associated Cas5 family protein  40.11 
 
 		 232 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4090  CRISPR-associated protein Cas5 family  35.36 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.509678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1899  CRISPR-associated protein Cas5 family  37.78 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3906  CRISPR-associated protein Cas5 family  33.15 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2442  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.52 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.844611 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2633  CRISPR-associated Cas5e family protein  50 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.405174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1597  CRISPR-associated Cas5e family protein  43.4 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0035372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1532  Cas5 family CRISPR-associated protein  35.67 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0481133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2576  CRISPR-associated Cas5 family protein  36.16 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0636812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0944  CRISPR-associated protein Cas5 family  42.42 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3051  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.35 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000204207  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17320  CRISPR-associated protein, Cas5e family  29.44 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0985  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.05 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2683  CRISPR-associated protein Cas5 family  46.59 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000775366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0831  CRISPR-associated Cas5 family protein  32.37 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.842897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0647  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.91 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1975  CRISPR-associated Cas5 family protein  31.29 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.40631  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1284  CRISPR-associated protein Cas5 family  41.38 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13900  CRISPR-associated protein Cas5  35.85 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.872767  normal  0.507161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17170  CRISPR-associated protein Cas5  35.71 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0927  CRISPR-associated protein Cas5 family  34.29 
 
 		 249 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0763  CRISPR system CASCADE complex protein CasD  34.12 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1589  CRISPR-associated Cas5e family protein  32.03 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  26.6 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0021  CRISPR-associated Cas5e family protein  28.43 
 
 		 276 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.538245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0484  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.15 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.325433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0782  CRISPR-associated protein Cas5 family  30.33 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2675  CRISPR-associated Cas5 family protein  39.06 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0907  CRISPR-associated protein Cas5 family  31.73 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.680141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>