More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0605 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  61.11 
 
 
200 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000500  putative phosphatase YqaB  60.66 
 
 
185 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000081388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.35 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  42.27 
 
 
194 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  41.62 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  41.62 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  41.62 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  42.7 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  41.08 
 
 
188 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  41.08 
 
 
188 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  41.08 
 
 
188 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  41.08 
 
 
188 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  42.7 
 
 
269 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  42.7 
 
 
188 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  42.7 
 
 
188 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.08 
 
 
188 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  42.16 
 
 
187 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  42.16 
 
 
188 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0179  phosphatase  42.46 
 
 
200 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  38.04 
 
 
188 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  39.11 
 
 
188 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  41.34 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  41.34 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  41.34 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.17 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3209  fructose-1-phosphatase  37.99 
 
 
188 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000636798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1118  fructose-1-phosphatase  37.43 
 
 
188 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000766383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1000  fructose-1-phosphatase  39.13 
 
 
188 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.341629  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  37.43 
 
 
188 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.22 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1830  phosphatase  34.43 
 
 
204 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0401626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
238 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2141  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.97 
 
 
200 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.189137  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
202 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
202 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  36.26 
 
 
202 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.71 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1395  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.4 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.54 
 
 
193 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0770  putative phosphatase  33.33 
 
 
200 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.737749  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.05 
 
 
219 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  32.98 
 
 
214 aa  101  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  33.85 
 
 
219 aa  101  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.77 
 
 
220 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.2 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.72 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
231 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  34.04 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1556  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000353855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  30.81 
 
 
227 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0376  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000217778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.51 
 
 
217 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  32.28 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  30.22 
 
 
227 aa  91.3  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.61 
 
 
456 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  29.94 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.98 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.61 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 
219 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.81 
 
 
234 aa  88.2  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.59 
 
 
456 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  27.46 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.26 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  30.98 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  31.11 
 
 
986 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  29.94 
 
 
225 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.73 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.67 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.42 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
223 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  30.68 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  30.77 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.63 
 
 
227 aa  85.1  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  31.38 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.53 
 
 
965 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.61 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  31.02 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  29.03 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  27.86 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1231  HAD family hydrolase  33.58 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2043  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.83 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.11 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  29.51 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.51 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  29.51 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  32.45 
 
 
728 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  29.51 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.06 
 
 
456 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  29.51 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  30.27 
 
 
585 aa  82  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.86 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>