237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0432 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  54.12 
 
 
654 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  50.94 
 
 
665 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  55.14 
 
 
660 aa  739    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  58.59 
 
 
649 aa  795    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  54.06 
 
 
682 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  58.54 
 
 
645 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  54.28 
 
 
654 aa  716    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  54.28 
 
 
654 aa  715    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  50.85 
 
 
654 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  51.16 
 
 
657 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  55.64 
 
 
656 aa  741    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  55.07 
 
 
654 aa  738    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  55.18 
 
 
654 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  54.87 
 
 
678 aa  720    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  100 
 
 
653 aa  1350    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  54.22 
 
 
670 aa  732    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  54.76 
 
 
654 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  52.6 
 
 
646 aa  698    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  53.65 
 
 
654 aa  710    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  54.83 
 
 
662 aa  723    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  53.57 
 
 
654 aa  698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  46.07 
 
 
670 aa  545  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  45.27 
 
 
663 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  41.51 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  35.97 
 
 
646 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  36.79 
 
 
634 aa  353  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  31.08 
 
 
633 aa  276  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  30.36 
 
 
649 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  33.05 
 
 
633 aa  272  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  30.38 
 
 
640 aa  266  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  32.22 
 
 
696 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  32.64 
 
 
633 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  30.19 
 
 
633 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  30.81 
 
 
635 aa  262  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  30.75 
 
 
656 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  31.91 
 
 
695 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  30.74 
 
 
647 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  30.25 
 
 
652 aa  249  9e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  30.84 
 
 
712 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  30.82 
 
 
666 aa  244  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  31.84 
 
 
652 aa  241  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  31.38 
 
 
712 aa  238  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  29.04 
 
 
650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  28.84 
 
 
633 aa  232  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  27.61 
 
 
700 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  28.91 
 
 
628 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  27.41 
 
 
700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  27.87 
 
 
697 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  28.29 
 
 
611 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  26.86 
 
 
685 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.01 
 
 
685 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  26.86 
 
 
685 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  27.41 
 
 
690 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  26.4 
 
 
717 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  28.59 
 
 
695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  28.62 
 
 
695 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  29.3 
 
 
621 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  26.86 
 
 
643 aa  177  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  28.91 
 
 
550 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  26.95 
 
 
597 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  25.89 
 
 
677 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  23.93 
 
 
651 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  29.47 
 
 
641 aa  121  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  22.61 
 
 
645 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  24.5 
 
 
677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  24.9 
 
 
671 aa  117  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  24.27 
 
 
642 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  22.63 
 
 
643 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  23.89 
 
 
628 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  27.61 
 
 
630 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  26.77 
 
 
666 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.53 
 
 
609 aa  91.3  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  24.36 
 
 
639 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  23.81 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  22.67 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  23 
 
 
628 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  23.53 
 
 
639 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  21.42 
 
 
627 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  23.53 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  23.4 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  22.74 
 
 
628 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  23.4 
 
 
642 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.74 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  22.74 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  22.74 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  22.74 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  22.74 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  23.46 
 
 
642 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  23.39 
 
 
628 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  23.39 
 
 
628 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  23.15 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  23.16 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  22.96 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  25.69 
 
 
701 aa  81.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3516  phosphoglycerol transferase I  24.51 
 
 
738 aa  81.6  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0478646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.39 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  22.69 
 
 
639 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  23.01 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  24.63 
 
 
629 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  22.7 
 
 
642 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>