More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0069 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0069  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 493 aa  1012    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 494 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 500 aa  544  1e-153  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf860  lysyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl030  lysyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 		 499 aa  528  1e-148  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 499 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 496 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 		 495 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 494 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 504 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 495 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 493 aa  473  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 631 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 510 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.9 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 497 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 		 489 aa  443  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 647 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 489 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  42.3 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 504 aa  418  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 573 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 491 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 502 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 573 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 505 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0009  lysyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00617172  hitchhiker  0.00000378083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 510 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 573 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 500 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 500 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 500 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  43.81 
 
 		 771 aa  403  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 484 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 505 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1370  lysyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 578 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.394303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 496 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 503 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  41.67 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 503 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4009  lysyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 502 aa  401  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0450  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.685874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>