188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1472 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1472  Radical SAM domain protein  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
256 aa  158  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2906  radical SAM family protein  42.44 
 
 
306 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 
242 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 
242 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
258 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1856  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 
288 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.587316  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 
258 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 
281 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  34.02 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  35.98 
 
 
182 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  35.44 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  34.45 
 
 
352 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  34.52 
 
 
352 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5254  radical SAM domain protein  34.13 
 
 
352 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  35.68 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 
352 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  36.98 
 
 
350 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4818  Radical SAM domain protein  34.54 
 
 
350 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  36.53 
 
 
352 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 
352 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
267 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  34.11 
 
 
368 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
392 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  35.18 
 
 
362 aa  102  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 
288 aa  102  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  37.5 
 
 
366 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  35.43 
 
 
385 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
388 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 
357 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  34.85 
 
 
392 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
392 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 
363 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  33.71 
 
 
384 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 
392 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  33.49 
 
 
385 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  33.66 
 
 
392 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 
375 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  30.94 
 
 
356 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  33.33 
 
 
386 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
380 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
385 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 
437 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  37.56 
 
 
385 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
402 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
383 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  35.12 
 
 
365 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 
385 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 
374 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 
376 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  33.17 
 
 
374 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  33.18 
 
 
391 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
386 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 
372 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 
385 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  35.23 
 
 
360 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0742  radical SAM family protein  35.42 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.669971  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4284  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  33.96 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  33.33 
 
 
393 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  30.24 
 
 
354 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  35.54 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  32.89 
 
 
386 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  34.34 
 
 
381 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  32.46 
 
 
387 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1721  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 
302 aa  95.5  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0387  hypothetical protein  31.07 
 
 
390 aa  95.5  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  31.28 
 
 
387 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0399  hypothetical protein  31.07 
 
 
390 aa  95.5  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0047  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.71 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 
357 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
386 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  35.03 
 
 
417 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1698  transporter  29.72 
 
 
325 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2479  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 
368 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.874205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  35.63 
 
 
360 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6071  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 
372 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 
301 aa  94  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 
362 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1071  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
360 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 
362 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 
359 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  32.93 
 
 
297 aa  92.4  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00810  putative DNA repair photolyase  33.95 
 
 
352 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>