47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1459 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 113 aa  224  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  48.11 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  65.67 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  41.59 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  34.91 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  46.6 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  44.23 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  42.71 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  42.62 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1617  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.27 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.450393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  35.44 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  49.06 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1748  DNA polymerase beta subunit  49.21 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000372139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1920  DNA polymerase beta subunit  35.9 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  42.19 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  37.68 
 
 		 260 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3436  DNA polymerase beta subunit  36.84 
 
 		 107 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4127  hypothetical protein  42.19 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129079 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2347  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.048778  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5631  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000350885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  35.42 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3041  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  48.94 
 
 		 155 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0576  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 121 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.28507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3846  DNA polymerase beta subunit  38 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000154582  unclonable  0.00000693944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0354  DNA polymerase beta subunit  36.36 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0463  DNA polymerase beta subunit  47.06 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  67.86 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2470  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.22963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  40.62 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0574  DNA polymerase beta subunit  38.36 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412375  normal  0.178688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  32.18 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0145  hypothetical protein  36.23 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.345001  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1044  DNA polymerase beta subunit  69.23 
 
 		 122 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>