74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0783 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 375 aa  728    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.82 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  31.02 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.11 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  33.44 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.85 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  31.63 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  25.55 
 
 		 379 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.93 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.08 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2291  hypothetical protein  31.39 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0761399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  25.72 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0005  geranylgeranyl reductase  31.64 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  28.74 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  27.44 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.84 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1401  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  26.93 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1166  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.355185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  21.25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  23.77 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  21.8 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  21.05 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.04 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  22.98 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  21.66 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.09 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  22.03 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 329 aa  49.7  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 452 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  24.11 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.02 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  26.18 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  22.76 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  22.4 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.11 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  21.69 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  22.12 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  23.05 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  21.68 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25.78 
 
 		 453 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5207  monooxygenase, FAD-binding protein  28.47 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00824524  normal  0.643607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>