183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3643 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3643  trehalose-phosphatase  100 
 
 		 253 aa  478  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0807  trehalose-phosphatase  47.28 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5099  HAD family hydrolase  47.41 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4714  HAD family hydrolase  47.41 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4800  HAD family hydrolase  47.41 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3711  trehalose-phosphatase  45.28 
 
 		 847 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0320844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1458  HAD family hydrolase  47.62 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.450575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0370  trehalose-phosphatase  45.04 
 
 		 842 aa  171  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4643  trehalose-phosphatase  42.06 
 
 		 867 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.016054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35060  trehalose 6-phosphatase  44.9 
 
 		 844 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.746667 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4915  trehalose-phosphatase  43.03 
 
 		 744 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5313  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3919  HAD family hydrolase  43.7 
 
 		 867 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.936294  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19360  trehalose-phosphatase  44.14 
 
 		 761 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.752933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3544  HAD family hydrolase  42.44 
 
 		 867 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31710  trehalose-phosphatase  45.24 
 
 		 277 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0919  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.36 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0356723  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5011  trehalose-phosphatase  46.4 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2064  trehalose-phosphatase  40.5 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0675  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.98 
 
 		 265 aa  118  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.418374  hitchhiker  0.000831197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0751  HAD family hydrolase  40.48 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.15 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03830  trehalose-phosphatase  37.11 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.872601  normal  0.0458529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0795  trehalose-phosphatase  41.41 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  36.25 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3889  glycoside hydrolase 15-related protein  34.69 
 
 		 893 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3062  trehalose-phosphatase  37.3 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0400  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30 
 
 		 733 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733308  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4792  trehalose-phosphatase  32.89 
 
 		 738 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5206  trehalose-phosphatase  38.46 
 
 		 417 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0820475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4211  trehalose-phosphatase  38.6 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  36.21 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3680  glycoside hydrolase 15-related  35.04 
 
 		 876 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1021  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.6 
 
 		 745 aa  89  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00530094  normal  0.902731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  35.43 
 
 		 1225 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  36.51 
 
 		 391 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5219  trehalose-phosphatase  33.47 
 
 		 294 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 1186 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  35.53 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  35.53 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2389  HAD family hydrolase  38.56 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.812427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  37.56 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.46 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2061  trehalose-phosphatase  33.86 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.46 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.292161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  36.91 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  36.07 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1092  trehalose-phosphatase  36.26 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.693054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  31.28 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  33.07 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0273  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.88 
 
 		 737 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0345  HAD family hydrolase  36.78 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0522927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.94 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2155  HAD family hydrolase  35.12 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  33.94 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5768  trehalose-phosphatase  31.92 
 
 		 731 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2949  trehalose-phosphatase  39.33 
 
 		 775 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2336  trehalose-phosphatase  33.88 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.922913  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1339  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  29.46 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0054  trehalose-phosphatase  32.38 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2216  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  30.3 
 
 		 752 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2229  trehalose-phosphatase  29.07 
 
 		 725 aa  76.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4022  trehalose-phosphatase  27.6 
 
 		 724 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179404  normal  0.381996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.48 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  32.79 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.06 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0224  trehalose-phosphatase  37.31 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  34.06 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  34.67 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1131  HAD family hydrolase  37.1 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219711  normal  0.0112518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.49 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 1215 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 1215 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.98 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 1215 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0799  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  28.82 
 
 		 733 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0598  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  33.33 
 
 		 735 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.289814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  35.24 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1808  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.11 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4394  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.553746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  32.2 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1363  putative bifunctional trehalose-6-phosphate synthase/HAD hydrolase subfamily IIB  35.02 
 
 		 751 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.475191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  29.63 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2549  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  32.43 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  30.42 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3128  trehalose-phosphatase  31.87 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>