More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1308 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1308  4-aminobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 450 aa  888    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.518173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3094  4-aminobutyrate aminotransferase  71.97 
 
 		 468 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2798  4-aminobutyrate aminotransferase  72.38 
 
 		 456 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4960  4-aminobutyrate aminotransferase  68.15 
 
 		 432 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2313  4-aminobutyrate aminotransferase  64.63 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233271  normal  0.897192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1723  4-aminobutyrate aminotransferase  68.33 
 
 		 451 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2274  4-aminobutyrate aminotransferase  64.63 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2321  4-aminobutyrate aminotransferase  64.63 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42867  normal  0.490264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2581  4-aminobutyrate aminotransferase  63.49 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120886  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1034  4-aminobutyrate aminotransferase  62.24 
 
 		 453 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0355081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3818  4-aminobutyrate aminotransferase  62.92 
 
 		 450 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104054  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3205  4-aminobutyrate aminotransferase  62.87 
 
 		 450 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10360  4-aminobutyrate aminotransferase  64.07 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.70128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1956  4-aminobutyrate aminotransferase  61.33 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7835  4-aminobutyrate aminotransferase  61.82 
 
 		 443 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3663  4-aminobutyrate aminotransferase  63.45 
 
 		 445 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0690  4-aminobutyrate aminotransferase  63.7 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12609  4-aminobutyrate aminotransferase  62.47 
 
 		 449 aa  499  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.20545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0645  4-aminobutyrate aminotransferase  66.51 
 
 		 452 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0897  4-aminobutyrate aminotransferase  60.31 
 
 		 489 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1858  4-aminobutyrate aminotransferase  58.43 
 
 		 450 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1093  4-aminobutyrate aminotransferase  59.57 
 
 		 441 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1424  4-aminobutyrate aminotransferase  65.89 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0991772  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3824  4-aminobutyrate aminotransferase  65.18 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0707619  normal  0.0367563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1534  4-aminobutyrate aminotransferase  50.11 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46092  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  44.72 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  44.62 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  43.89 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  44.62 
 
 		 479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  45.29 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  44.5 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  50.34 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  44.39 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2000  4-aminobutyrate aminotransferase  50.23 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  43.25 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2245  4-aminobutyrate aminotransferase  43.72 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0119  4-aminobutyrate aminotransferase  47.65 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4851  4-aminobutyrate aminotransferase  48.26 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3364  4-aminobutyrate aminotransferase  48.6 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5241  4-aminobutyrate aminotransferase  48.14 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4909  4-aminobutyrate aminotransferase  48.37 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3005  4-aminobutyrate aminotransferase  48.14 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4711  4-aminobutyrate aminotransferase  47.91 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5361  4-aminobutyrate aminotransferase  48.14 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0280  4-aminobutyrate aminotransferase  47.32 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.969383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3864  4-aminobutyrate aminotransferase  47.38 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1618  4-aminobutyrate aminotransferase  48.92 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.346531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2338  4-aminobutyrate aminotransferase  46.9 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  46.86 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4618  4-aminobutyrate aminotransferase  46.95 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  0.10828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3398  4-aminobutyrate aminotransferase  48.56 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1910  4-aminobutyrate aminotransferase  47.28 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.692445  normal  0.29202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3721  4-aminobutyrate aminotransferase  47.85 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0834  4-aminobutyrate aminotransferase  48.21 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1978  4-aminobutyrate aminotransferase  45.84 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4519  4-aminobutyrate aminotransferase  47.89 
 
 		 427 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0029  4-aminobutyrate aminotransferase protein  49.03 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4414  4-aminobutyrate aminotransferase  50.36 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.877124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  49.88 
 
 		 439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03450  4-aminobutyrate aminotransferase  46.45 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.22305e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2002  4-aminobutyrate aminotransferase  47.72 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  48.59 
 
 		 428 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2371  4-aminobutyrate aminotransferase  50.25 
 
 		 440 aa  359  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0827884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  45.73 
 
 		 440 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0344  4-aminobutyrate aminotransferase  46.21 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5049  4-aminobutyrate aminotransferase  48.25 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  0.62875 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0848  4-aminobutyrate aminotransferase  47.49 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4167  4-aminobutyrate aminotransferase  46.93 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.130001  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2545  4-aminobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3172  4-aminobutyrate aminotransferase  48.07 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0214  4-aminobutyrate aminotransferase  45.37 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0229  4-aminobutyrate aminotransferase  45.37 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4695  4-aminobutyrate aminotransferase  46.6 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01279  GABA aminotransferase, PLP-dependent  46.35 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2344  4-aminobutyrate aminotransferase  46.35 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00720647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01290  hypothetical protein  46.35 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0315  4-aminobutyrate aminotransferase  46.73 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1512  4-aminobutyrate transaminase  46.35 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2323  4-aminobutyrate transaminase  46.35 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2233  4-aminobutyrate aminotransferase  45.04 
 
 		 421 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1538  4-aminobutyrate transaminase  46.08 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.535334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1944  4-aminobutyrate transaminase  46.24 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.991898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1417  4-aminobutyrate transaminase  46.35 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0238  4-aminobutyrate aminotransferase  45.13 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1820  4-aminobutyrate transaminase  46.01 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2924  4-aminobutyrate aminotransferase  45.87 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.647687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02518  4-aminobutyrate aminotransferase  44.15 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1021  4-aminobutyrate aminotransferase  44.15 
 
 		 426 aa  353  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02482  hypothetical protein  44.15 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1889  4-aminobutyrate aminotransferase  47.65 
 
 		 435 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148357  normal  0.0202633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4306  4-aminobutyrate aminotransferase  47.37 
 
 		 421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0293  hypothetical protein  45.1 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3904  4-aminobutyrate aminotransferase  44.15 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.888156 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1044  4-aminobutyrate aminotransferase  43.91 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>