More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1112 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
911 aa  1737    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  67.44 
 
 
906 aa  1042    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.6 
 
 
782 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  46.25 
 
 
792 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.55 
 
 
769 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.51 
 
 
768 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.31 
 
 
764 aa  539  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.51 
 
 
768 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.92 
 
 
785 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  44.04 
 
 
793 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.92 
 
 
767 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  41.06 
 
 
889 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.11 
 
 
770 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  49.62 
 
 
775 aa  521  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  42.25 
 
 
891 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.39 
 
 
772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.47 
 
 
765 aa  515  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.55 
 
 
766 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.63 
 
 
792 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.28 
 
 
767 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.49 
 
 
952 aa  505  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.86 
 
 
791 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.32 
 
 
786 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.06 
 
 
781 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.82 
 
 
765 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  48.37 
 
 
827 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.12 
 
 
767 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.57 
 
 
953 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.46 
 
 
969 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  43.88 
 
 
790 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.48 
 
 
932 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.3 
 
 
932 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.24 
 
 
997 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.59 
 
 
966 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.12 
 
 
959 aa  459  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.41 
 
 
933 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.86 
 
 
972 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.18 
 
 
971 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.24 
 
 
953 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.37 
 
 
930 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.38 
 
 
931 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.04 
 
 
966 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.34 
 
 
931 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.42 
 
 
931 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.76 
 
 
970 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.84 
 
 
983 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.79 
 
 
981 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0728  quinone dependent NADH dehydrogenase  45.29 
 
 
746 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.37 
 
 
930 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.83 
 
 
958 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.01 
 
 
949 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.67 
 
 
933 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 
969 aa  446  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.05 
 
 
967 aa  445  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.61 
 
 
980 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.89 
 
 
992 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.96 
 
 
999 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.67 
 
 
949 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.67 
 
 
949 aa  439  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.91 
 
 
958 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.07 
 
 
946 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.26 
 
 
933 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.67 
 
 
971 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.06 
 
 
971 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.63 
 
 
790 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.01 
 
 
984 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.25 
 
 
943 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.9 
 
 
984 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.06 
 
 
971 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.51 
 
 
964 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.51 
 
 
964 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.22 
 
 
971 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.65 
 
 
1024 aa  426  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.66 
 
 
978 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.38 
 
 
1006 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  36.61 
 
 
1003 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  37.24 
 
 
972 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.12 
 
 
947 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.41 
 
 
943 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.61 
 
 
975 aa  420  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.6 
 
 
931 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.13 
 
 
972 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.98 
 
 
979 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.8 
 
 
938 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.27 
 
 
975 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.18 
 
 
799 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.98 
 
 
979 aa  415  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.84 
 
 
941 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.66 
 
 
961 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.92 
 
 
1004 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.46 
 
 
962 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.04 
 
 
973 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.66 
 
 
975 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.32 
 
 
788 aa  405  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.53 
 
 
956 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.44 
 
 
935 aa  400  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.91 
 
 
1014 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.72 
 
 
950 aa  399  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.72 
 
 
801 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.62 
 
 
969 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>